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线虫脂代谢调控基因筛选及一碳代谢对脂代谢影响研究的任务书 任务书 任务名称:线虫脂代谢调控基因筛选及一碳代谢对脂代谢影响研究 任务背景: 脂代谢是生物体中最重要的代谢过程之一,能源储备和信号传递等功能使得脂代谢受到广泛关注。线虫是受欢迎的模式生物之一,也是研究基因调控、代谢调控和生物学机制的重要实验模型。线虫脂代谢调控的分子机制还有待深入探究。本研究将通过筛选线虫脂代谢调控的基因和研究其相关机制,探讨一碳代谢对脂代谢的影响,为线虫生物学的研究提供新思路和实验数据。 任务目标: 1.综合利用生物信息学分析和基因编辑技术筛选出线虫脂代谢调控的基因; 2.利用表观遗传学和基因调控等技术探讨这些基因的调控机制; 3.研究一碳代谢对脂代谢的影响及其分子机制; 4.对研究结果进行生物学功能鉴定,挖掘出脂代谢和代谢调控领域的新知识。 任务内容: 1.对线虫基因组数据进行生物信息学分析,预测潜在脂代谢调控相关基因; 2.构建基因编辑系统,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术实现潜在基因的选择性敲除; 3.结合表观遗传学和基因调控等技术,解析筛选出的基因的调控机制; 4.建立一碳代谢的线虫模型,并对模型中的脂代谢相关基因进行研究; 5.利用基因功能鉴定、药物筛选等手段验证前期实验结果,并对研究结果进行数据分析和整合。 任务计划: 第一年: 1.对线虫基因组进行生物信息学分析,筛选出潜在的脂代谢调控基因; 2.构建CRISPR/Cas9基因编辑系统,并对潜在基因进行敲除筛选; 3.建立线虫一碳代谢模型,初步探索线虫脂代谢调控和一碳代谢的相互作用。 第二年: 1.鉴定脂代谢调控相关基因的表观遗传学和基因调控机制; 2.深入研究一碳代谢对脂代谢的影响,挖掘相关基因和分子机制; 3.对研究结果进行生物学功能鉴定,验证前期实验结果。 第三年: 1.利用药物筛选等手段验证研究结果,揭示脂代谢调控和一碳代谢的相互作用; 2.对研究结果进行数据分析和整合,撰写研究论文,并参与学术交流和学术报告。 预期成果: 本研究将从分子、生物化学、细胞生物学和遗传学等多角度探讨线虫脂代谢调控的分子机制和一碳代谢的影响,形成以下预期成果: 1.筛选出一批脂代谢调控相关基因,并探究这些基因的调控机制; 2.揭示线虫一碳代谢的影响机制,阐明一碳代谢与脂代谢调控的相互作用; 3.在脂代谢调控和代谢调控等领域发表相关的学术论文,并积极参与学术交流和学术报告。 参考文献: 1.Jones,L.M.,Martelli,A.,Gill,R.,&McIntire,S.L.(2018).AcomputationalmethodforannotationoftailbitingandconservedtailtargetsinCaenorhabditiselegans.Nucleicacidsresearch,46(4),e23-e23. 2.Nakamura,S.,&Iwanami,T.(2021).MetabolicControlinCaenorhabditiselegansLifeSpan.FrontiersinEndocrinology,12,727020. 3.Liu,W.Y.,Zhang,Q.,Huang,C.Y.,Yang,Y.W.,Chen,S.D.,Wang,K.,...&Yang,H.(2019).Onecarbonmetabolismandbreastcancer:anoverview.Journalofbiochemicalandmoleculartoxicology,33(6),e22347.