长期施用猪粪对土壤中抗生素抗性基因和细菌多样性的影响的任务书.docx

长期施用猪粪对土壤中抗生素抗性基因和细菌多样性的影响的任务书
任务背景：
随着经济的快速发展和人口增长的加速，农业生产迅速发展，而肥料的施用则是农业生产的必要要素之一。而其中的猪粪作为一种常见的有机肥料，在农业生产中得到了广泛的应用。然而，随着猪养殖规模的不断增加和生产方式的改变，猪粪中的抗生素使用频率也越来越高，从而导致了农用土壤中抗生素抗性问题的凸显。而由于抗生素与抗生素抗性基因的复杂性，目前对农用土壤中抗生素抗性基因的来源和演化仍存在很多争议。因此，本任务将探讨猪粪施用对土壤中抗生素抗性基因和细菌多样性的影响，以期为农业生产提供一定的参考与指导。
任务目的和意义:
研究长期施用猪粪对土壤中抗生素抗性基因和细菌多样性的影响，对于了解农用土壤中抗生素作用的机理与消除土壤中的抗生素抗性问题具有重要的理论和实践意义，同时，也有助于探索土壤中抗生素抗性基因来源及其演化过程，为开展相关研究提供一定的理论支持。
任务内容：
1、收集资料，了解目前对于猪粪施用对土壤中抗生素抗性基因和细菌多样性的影响研究的现状，并梳理研究思路和方法，初步制定研究方案。
2、采集不同施用猪粪土壤的样品，采用高通量测序技术测序，比较实验组和对照组样品中细菌多样性的变化。
3、采用实时荧光定量PCR(qPCR)方法分别检测实验组和对照组样品中常见抗生素抗性基因（ARGs）的数量和种类。
4、分析检测结果，比较实验组和对照组的样品中细菌多样性和抗生素抗性基因的数量和种类的差异，并分析相关因素的影响。
5、撰写实验结果和分析报告，并对研究过程和结论进行深入探讨和讨论。
任务计划和进度：
团队成员共同协作完成，预计需要2个月时间:
第1周：梳理资料，建立研究思路，初步制定研究方案
第2-3周：采集不同施用猪粪土壤的样品，处理土壤样品
第4周：对土壤样品进行高通量测序，检测细菌多样性的变化
第5-6周：使用qPCR方法检测实验组和对照组样品中常见抗生素抗性基因（ARGs）的数量和种类
第7-8周：分析检测结果，比较实验组和对照组的样品中细菌多样性和抗生素抗性基因的数量和种类的差异，并分析相关因素的影响
第9周：撰写实验结果和分析报告
第10周：讨论研究过程和结论
任务参考文献：
1.CyconM,MrozikA,Piotrowicz-CieślakAI,etal.Impactofplantgrowth-promotingrhizobacteriainoculationonmacrofaunaandbiologicalactivityofsoilinlong-termmonocultureofmaize[J].ScienceofTheTotalEnvironment,2021,776:145815.
2.DingL,SuJQ,ZhangYQ,etal.Long-termfieldapplicationofsewagesludgeincreasestheabundanceofantibioticresistancegenesinsoil[J].EnvironmentInternational,2020,146:106103.
3.HampelH,GutierrezMG,KjeldsenP,etal.Manure-derivedfaecalpollutionaffectsmicrobialcommunityfunctionandantibioticresistancegeneabundanceinArcticsoils[J].EnvironmentalResearch,2020,189:109906.
4.NilssonO,RosenqvistH,LaudonH,etal.Long-termincreasednitrogendepositionalteredthesoilfungalcommunityandstimulatedtheabundanceofammonia-oxidizingarchaeaandbacteria[J].EnvironmentalResearchLetters,2017,12(6):065007.
5.ZhangX,QinS,WangS,etal.Quantitativeanalysesofantibioticresistancegenesinwater,soil,andairsamplescollectedfromdifferentpigfarms[J].ScienceofTheTotalEnvironment,2020,739:139924.