山黧豆属SSR分子标记开发及遗传多样性分析任务书.docx

山黧豆属SSR分子标记开发及遗传多样性分析任务书
一、任务背景：
山黧豆科灌木植物山黧豆属（Lathyrus）是全球性的重要的经济作物之一，包括大约180种，在欧洲、亚洲和非洲等地广泛分布。山黧豆属作为绿肥和饲料资源广泛应用于农业，同时在医学上也有一定的药用价值。此外，山黧豆素也是一种重要的食品基础成分，用于制作黄豆酸奶、豆奶和豌豆等植物蛋白饮料。
研究山黧豆属的分子标记和遗传多样性，不仅有助于了解山黧豆属的起源、进化和种间关系，还有助于山黧豆属的遗传改良和保护。因此，本任务旨在开发山黧豆属的SSR分子标记，并对其进行遗传多样性分析。
二、任务内容：
1.筛选适合山黧豆属的SSR引物，设计实验方案并开展PCR反应，筛选出高质量的SSR标记。
2.针对山黧豆属不同品种和野生种，利用开发出的SSR标记进行遗传多样性分析，推断遗传多样性和亲缘关系。
3.撰写实验报告，总结研究成果，提出进一步的研究方向和建议。
三、任务计划：
1.前期准备：
(1)查阅山黧豆属的相关文献和研究资料，了解其基本信息、特点及已有的SSR分子标记。
(2)收集山黧豆属不同品种和野生种的DNA样本，并进行DNA提取、稀释、存储等相关操作。
(3)筛选合适的SSR引物，设计PCR反应方案，优化反应条件，并进行PCR扩增实验。
2.实验操作：
(1)选取10-20对优质的SSR引物，在不同山黧豆属品种和野生种进行PCR反应。
(2)根据PCR扩增结果，筛选出高质量的SSR标记，并记录其位置、大小、颜色等特征。
(3)在已知的5-10个山黧豆属品种和野生种之间进行遗传多样性分析。
3.数据处理：
(1)根据PCR扩增结果，用生物信息学软件进行数据处理、分析并得到SSR基因的分布情况。
(2)根据得到的SSR标记数据，计算遗传多样性参数，如遗传多样性指数、多态信息含量、群体分化指数等，并绘制图表进行统计分析。
(3)根据遗传多样性数据，推断品种间和野生种间的遗传关系，并绘制遗传关系图。
4.撰写实验报告：
(1)撰写实验报告，总结研究成果，讨论结果的意义和不足。
(2)提出进一步研究的方向和建议，为山黧豆属的遗传改良和保护提供科学依据。
四、预期成果：
通过本次任务的开展，预期可以：
(1)开发出一批高质量的山黧豆属SSR标记，为山黧豆属的遗传多样性和亲缘关系分析提供技术支持。
(2)对不同山黧豆属品种和野生种的遗传多样性进行分析，推断品种间和野生种间的遗传关系，为山黧豆属的品种保护和改良提供科学依据。
(3)撰写实验报告，并提出进一步研究的方向和建议。