温室迷你黄瓜配合力分析及嫩果皮白色相关基因的初步定位的任务书.docx

温室迷你黄瓜配合力分析及嫩果皮白色相关基因的初步定位的任务书
任务书
课题名称：温室迷你黄瓜配合力分析及嫩果皮白色相关基因的初步定位
研究目的：通过对温室迷你黄瓜进行配合力分析，探究其杂种优势及其形成机制；并通过基因定位和比较基因组学方法初步探讨嫩果皮白色相关基因的定位。
研究内容：
1.温室迷你黄瓜杂交及配合力分析。选择与本地品种进行杂交，观测其生长发育情况，记录产量及其他重要农艺性状，分析其杂种优势及配合力。
2.温室迷你黄瓜基因组测序及分析。采用二代测序技术对温室迷你黄瓜进行基因组测序，分析其基因组特征，建立基因组图谱，寻找与嫩果皮白色相关的基因。
3.嫩果皮白色相关基因定位。通过比较基因组学方法，与已知结构的相关基因进行比对，将相关基因大致定位于某一染色体上，并进行进一步的克隆和鉴定，确定其与嫩果皮白色相关的作用机制。
研究方法：
1.温室迷你黄瓜杂交及配合力分析。选择与本地品种进行杂交，进行长期观察，记录育种特征和生物学特征。
2.温室迷你黄瓜基因组测序及分析。采用IlluminaHiSeqXten平台对温室迷你黄瓜进行基因组测序；获得数据进行质控和拼接，注释基因，进行目标基因的寻找。
3.嫩果皮白色相关基因定位。利用已有的参考基因组数据，基于比较基因组学方法，进行基因组DNA重测序，筛选出与嫩果皮白色相关的候选基因，并进行进一步的克隆鉴定。
研究意义：
温室迷你黄瓜是目前市场上受欢迎的果蔬之一。通过对其配对力分析，可以更好地了解其生长发育的特点，并在育种中选择最优异的亲本进行杂交，提高其生产效率和质量。同时，对其基因组进行测序分析，可以深入探究其遗传规律和生物学特性，发掘其潜在的用途。嫩果皮白色相关基因的定位对于揭示其遗传机制，推动黄瓜育种及果蔬产业健康发展也有重要的参考价值。
进度安排：
月份任务描述
第一月份调研文献，确定研究方向和内容，制定实验方案。
第二至八月采样收集温室迷你黄瓜样本并进行温室栽培管理。
第九至十一月进行温室迷你黄瓜杂交实验并对结果进行统计分析。
第十二至十五月实验数据的处理和统计分析，制备并提交实验结果报告。同时进行温室迷你黄瓜基因组测序。
第十六至十七月基因组数据分析和嫩果皮白色相关基因进行初步定位。
第十八至二十月对候选基因进行克隆鉴定，进行验证实验。
第二十一至二十四月数据整理，结论分析和撰写论文。
经费预算：
经费预算主要包括实验材料购买，实验设备和软件采购，调研费用，人工费用以及其他费用，共计30000元。
实验材料购买费：10000元
实验设备和软件采购费：8000元
调研费用：4000元
人工费用：5000元
其他费用：2000元
参考文献：
1.卢清泉.黄瓜育种[J].农学学报,2003,1(2):32-39.
2.黄卫华,王昌禹,窦淑宝etal.黄瓜基因组测序及注释[J].遗传,2014,36(8):797-807.
3.沈国庆,柳洪涛,龚建平等.基于RGB图像的黄瓜果皮颜色检测方法[J].农业工程学报,2018,34(2):62-68.