基于ISSR方法的云杉矮槲寄生遗传多样性研究的任务书.docx

基于ISSR方法的云杉矮槲寄生遗传多样性研究的任务书
任务书
题目：基于ISSR方法的云杉矮槲寄生遗传多样性研究
研究目的：
1.通过ISSR分子标记技术，探讨云杉矮槲寄生的遗传多样性状况。
2.研究云杉矮槲寄生的遗传多样性与其寄主云杉之间的关系。
3.为云杉矮槲寄生的保护及利用提供科学依据。
研究内容：
1.开展云杉矮槲寄生的野外调查，收集样品。
2.提取云杉矮槲寄生基因组DNA，进行ISSR扩增反应。
3.利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，分析ISSR扩增产物。
4.利用遗传相似系数计算聚类图，并解读聚类图结果。
5.利用遗传多样性指数（如多态性信息内容、Shannon多样性指数等）计算云杉矮槲寄生的遗传多样性指数。
6.应用AMOVA技术，分析云杉矮槲寄生之间的遗传多样性分化程度，进一步探究群体结构和基因流动状况。
7.利用适当的统计分析方法，比较云杉矮槲寄生与其寄主云杉之间的遗传相似性，研究二者之间的遗传联系。
研究流程：
1.搜集云杉矮槲寄生的样本，包括不同地理分布区域、寄主云杉树龄、海拔高度等相关信息。
2.提取不同样品的基因组DNA。
3.利用ISSR引物扩增，并使用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术分析扩增产物。
4.计算遗传相似系数，绘制聚类图。
5.利用遗传多样性指数计算云杉矮槲寄生的遗传多样性水平。
6.应用AMOVA技术，分析云杉矮槲寄生的群体结构及基因流动状况。
7.比较云杉矮槲寄生与其寄主云杉之间的遗传相似性。
时间计划：
第一年：
1.搜集云杉矮槲寄生样本，提取基因组DNA。
2.优化ISSR实验方案，开展ISSR扩增反应。
3.进行聚类分析，计算遗传相似系数。
第二年：
1.计算遗传多样性指数，探究云杉矮槲寄生的遗传多样性。
2.应用AMOVA技术，分析云杉矮槲寄生的群体结构及基因流动状况。
第三年：
1.比较云杉矮槲寄生与其寄主云杉之间的遗传相似性。
2.完成论文撰写及论文答辩等工作。
参考文献：
1.朱小平,李小丹,杨兵,王红霞.基于ISSR标记的凤仙花属植物遗传多样性研究[J].植物学报,2002,19(2):243-247.
2.张小梅,柳文焱,赵雷明.利用ISSR标记分析谷松矮槲寄生群体遗传多样性[J].大理大学学报,2007,6(4):30-34.
3.郭智强,李经熙,赵远,李玉,李伟栋.基于ISSR分子标记技术的海南海桐居群遗传多样性研究[J].中国农业大学学报,2005,10(2):83-88.