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壳菜果遗传多样性的ISSR研究的任务书 任务书 一、题目:壳菜果遗传多样性的ISSR研究 二、任务背景及意义: 壳菜果是传统的中药材之一,具有明显的药用价值。它主要是由壳科植物的果实构成,其中有效成分对人体有良好的保健作用,如健脾开胃、增强免疫力等。因此,对壳菜果进行遗传多样性研究有助于实现该植物资源的合理开发利用,推进壳菜果的产业化和规范化发展。 基于一系列生态环境和自身特性的原因,壳菜果资源的数量和分布区域不断受到限制和影响,同时,壳菜果易受外界环境的干扰,其资源面临严重的退化和破坏,甚至有濒危的风险。因此,进行壳菜果的遗传多样性研究是保护壳菜果资源、保障生态系统健康和推动经济发展的迫切需要。 三、研究目的: 1.了解壳菜果种群的遗传多样性及分布情况。 2.探究壳菜果的遗传结构和遗传多样性分布格局。 3.建立壳菜果的遗传资源数据库,为壳菜果的培育和改良提供基础数据。 四、研究范围: 本研究主要对中国境内壳菜果进行遗传多样性的ISSR研究,并对其进行系统分析、遗传多样性评估和遗传结构分析。同时,本研究还将分析地理环境对壳菜果遗传多样性的影响。 五、研究内容: 1.搜集壳菜果样本:通过野外实地调查及生物信息学的手段,收集并建立壳菜果样本库。 2.DNA提取:提取样本的基因组DNA,为ISSR分析做好准备。 3.ISSR扩增:利用ISSR标记技术,对样本进行PCR扩增处理,得到DNA的ISSR芯片图谱。 4.数据分析:对得到的ISSR芯片图谱进行数据处理分析,包括遗传多样性评价、遗传多样性的空间分布格局、遗传结构及谱系分析等。 5.结果解读:研究结果数据的科学解读和分析,得出遗传关系、遗传多样性分布的规律及其与生态环境因素的关联互动等信息,并对其产生的意义进行讨论和分析。 六、研究方法: 本研究采用速发核酸扩增技术(ISSR),检测壳菜果遗传多样性。同时,旨在探究遗传多样性和地理分布之间的关系,绘制遗传多样性的空间分布图。 七、数据处理与分析: 基于ISSR测序数据,利用POPGENE进行遗传多样性分析、遗传结构和分化分析,并根据遗传距离矩阵,进行遗传进化树计算、核心种群、遗传多样性格局等分析。 八、预期成果: 1.壳菜果的遗传多样性分析数据,得到遗传多样性的评价和分布格局。 2.基于研究结果,对壳菜果资源的保护和利用提出建设性建议。 3.发表相关的论文和科研成果。 九、研究时间安排: 本研究预计历时12个月,具体时间安排如下: 第1-3个月:搜集壳菜果样品并进行DNA提取 第4-6个月:进行ISSR扩增 第7-9个月:数据处理和分析 第10-12个月:研究报告撰写和论文投稿 十、研究资金预算: 硬件设备费用:30000元 试剂耗材费用:20000元 野外调查费用:10000元 研究报告费用:20000元 合计:80000元 十一、参考文献: [1]郝力.壳菜果资源调查及其开发利用研究[D].南昌大学,2012. [2]黄晓霞,徐志华,李瑛.壳菜果ISSR-PCR体系的初探[J].云南农业大学学报,2012,27(6):831-835. [3]熊慧,毛顺成,肖燕芳,等.利用ISSR分子标记评价金棉的遗传多样性[J].植物资源与环境学报,2014,23(02):56-60. [4]许小林,周鸣玲,章华戈,等.喜马拉雅山高山植物壳菜果遗传多样性的ISSR研究[J].植物遗传资源学报,2008,9(1):28-33。 [5]徐有芳,陈俊,陈正贵,等.基于ISSR标记的沙棘农化品种群遗传多样性分析[J].热带作物学报,2010,31(09):1509-1515+1546。