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小麦EST-SSR标记的开发和苗期养分吸收QTL定位的综述报告 随着基因组学技术的快速发展,越来越多的分子标记被用于小麦的基因定位和遗传分析。其中,EST-SSR是一种基于cDNA序列的分子标记,具有多态性和发现频率高等优点。 一、小麦EST-SSR标记的开发 小麦EST-SSR标记的开发主要基于EST(表达序列标记)库,这是一种由转录本构建的可表达序列库。EST是从基因组DNA转录而来的剪接变体,不仅包含基因的编码区,还包括非编码区,具有广泛的表达度和组织特异性,因此被广泛应用于分子标记开发和功能基因组学研究。 在小麦EST库中,含有大量SSR序列,可以使用PCR扩增和多态性分析来开发SSR标记。通常选择较长的重复单元作为SSR,因为它们有更高的多态性和稳定性。此外,可以利用比对软件和注释数据来预测SSR在转录本中的位置和类型,并根据预测结果设计引物。经过PCR扩增和多态性分析,可以筛选出具有多态性的EST-SSR标记,用于小麦遗传分析和基因定位。 二、苗期养分吸收QTL定位 苗期养分吸收是小麦幼苗生长的重要过程,与产量和品质密切相关。因此,苗期养分吸收QTL的定位是小麦遗传改良的重要目标之一。以氮素吸收为例,利用EST-SSR标记可以定位小麦苗期氮素吸收的QTL。 首先,选择具有良好的苗期氮素吸收性状的小麦近等基因系,通过交叉育种产生F2群体。然后,利用EST-SSR标记对F2群体进行基因分型,得到单倍型数据。根据单倍型数据,使用比较显著性连锁分析(CompositeIntervalMapping,CIM)和QTLCartographer软件,将苗期氮素吸收QTL定位在小麦染色体上。 利用EST-SSR标记和苗期氮素吸收QTL定位结果,可以筛选含有苗期氮素吸收基因的EST序列,进行生物信息分析和功能鉴定。同时,还可以挖掘其他与小麦营养吸收相关的QTL,为小麦遗传改良提供新的思路和技术手段。 综上所述,小麦EST-SSR标记的开发和苗期养分吸收QTL定位具有重要的意义,对小麦基因功能研究和遗传改良具有重要价值。