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水稻microRNAs及其靶点基因的进化与表达研究的中期报告
本研究旨在探讨水稻microRNAs（miRNAs）及其靶点基因的进化与表达。现将中期研究进展进行报告。
一、研究背景
miRNAs是一类约20-25nt的小RNA分子，在植物生长发育过程中扮演了重要角色。水稻（Oryzasativa）是重要的粮食作物，其基因组因为经历了两次全基因组复制事件而具有相对较大的基因家族。在水稻中，已知有多个miRNA家族，其中一些已经研究得比较透彻；而水稻miRNA的进化以及miRNA靶点基因的表达在整个稻田生态系统中的变化则尚未深入研究。
二、研究进展
1.miRNA靶点基因的鉴定
通过使用大规模转录组数据，我们对水稻中miRNA靶点基因进行预测和鉴定。目前已经鉴定出数千个可能的miRNA靶点基因，其中一些已经得到了实验验证。
2.水稻miRNA的进化
我们进一步研究了水稻中miRNA家族的进化历程。比较水稻和其他植物的miRNA序列，可以发现水稻特有的miRNA非常少，大部分miRNA都能在其他植物中找到对应的序列，这表明水稻miRNA的起源较早。但我们也发现了少数水稻特有的miRNA家族，这些miRNA在水稻的生长发育过程中可能具有特定的生物学功能，值得进一步研究。
3.miRNA在稻田生态系统中的表达
通过采集不同生长时期、不同部位的水稻植株并进行miRNA检测，我们发现不同生长时期、不同部位的水稻植株中miRNA的表达存在显著变化。这表明miRNA在水稻生长发育和稻田生态系统中扮演了复杂的调控作用，值得深入研究。
三、下一步工作计划
1.对于miRNA鉴定结果进行进一步筛选和验证，确定真正的miRNA靶点基因列表。
2.对于水稻miRNA家族的进化进行更深入的研究，包括比较分析miRNA序列和结构，确定水稻特有miRNA家族的生物学功能等。
3.进一步研究不同生长时期、不同部位水稻植株中miRNA的表达差异及其生物学意义。