小麦成熟胚和幼胚脱分化过程中MADS及靶基因的差异表达分析的任务书.docx

小麦成熟胚和幼胚脱分化过程中MADS及靶基因的差异表达分析的任务书
任务书
任务概述：
本任务的主要目标是对小麦成熟胚和幼胚脱分化过程中MADS及靶基因的差异表达进行分析和研究，以期更深入地了解小麦胚发育过程中的调控机制。该研究对小麦胚发育和遗传改良具有重要意义。
任务内容：
1.文献综述
对小麦胚发育过程中的MADS及靶基因进行文献调研，重点关注其分子调控机制、表达模式、生物学功能等方面的研究进展。
2.实验设计
根据文献综述的结果，结合实验室已有的研究成果，设计小麦成熟胚和幼胚的RNA-seq实验方案，包括RNA提取、测序、差异表达分析等。
3.实验操作
根据实验设计方案，进行RNA提取和测序操作。然后通过生物信息学分析和差异表达分析，研究成熟胚和幼胚的MADS及靶基因的差异表达情况。
4.数据分析
基于RNA-seq数据，进行数据预处理，包括数据质控、去除低质量序列、过滤低质量序列等。然后采用不同的生物信息学工具进行差异表达分析，寻找差异表达基因，并进行GO、KEGG通路富集分析和网络分析等。
5.结果解读和讨论
根据实验结果，从分子水平、表达模式、生物学功能等多个角度对小麦成熟胚和幼胚发育调控机制进行解释和讨论，把握其重要性和未来研究方向。
任务要求：
1.具备生物学、生命科学、农业科学等相关学科基础知识；
2.熟悉生物信息学和常用的生物信息学分析软件和工具；
3.具备概率统计和数学模型建立的基础知识；
4.具备实验室基本操作技能、实验设计和数据分析能力；
5.具有较强的文献查阅和论文撰写能力。
任务参考文献：
1.GoyalA.,etal.2016.Dynamicsofglobalgeneexpressionandregulatoryelementsduringthecourseofwheatcaryopsisdevelopment.BMCGenomics,17:584.
2.ZhouZ.,etal.2017.TranscriptomeAnalysisofGrain-FillingCaryopsesRevealsthePotentialRegulationMechanismofCarbon-NitrogenMetabolisminWheat.ScientificReports,7:8347.
3.YangF.,etal.2017.GlobalanalysisofMADS-boxgenesandtheirsoybeanhomologsrevealssoybean-specificduplicationsandfunctionaldivergence.Journalofexperimentalbotany,68(5),1235-1249.
4.GuoY.,etal.2018.SpatiotemporalexpressionandfunctionalanalysisofMADS-boxgenesduringearlywheatspikedevelopment.BMCPlantBiology,18:31.
任务时间安排：
本任务周期为2个月，具体时间安排如下：
第1-3周：文献调研，撰写文献综述
第4-6周：实验设计，进行RNA提取和测序操作
第7-8周：RNA-seq数据预处理和差异表达分析
第9-10周：GO、KEGG通路富集分析和网络分析等
第11-12周：结果解读和讨论，撰写研究报告
备注：以上时间为参考，具体时间安排可根据实际情况进行适当调整。