人类基因组中选择性剪接位点的预测及序列特征分析的任务书.docx

人类基因组中选择性剪接位点的预测及序列特征分析的任务书
任务书：
任务名称：人类基因组中选择性剪接位点的预测及序列特征分析。
任务背景：
选择性剪接是生物体内常见的基因表达调控方式之一，它能够实现单一基因所编码的蛋白质生成多个不同的亚型。在人类基因组中，大约95%的基因都存在选择性剪接现象，因此选择性剪接的研究对于生物医学研究和药物研发具有重要的意义。目前，在生物信息学领域，已有许多算法被应用于选择性剪接位点的预测，但是由于其复杂性和难以预测的性质，目前还缺乏准确识别选择性剪接位点的理论和方法。
任务内容：
本任务中，要求参赛者利用已有的人类基因组数据，对人类基因组中的选择性剪接位点进行预测，并对这些选择性剪接位点进行序列特征分析。具体任务包括：
1.利用生物信息学方法，从已有的人类基因组中提取参考序列。
2.利用已有的算法，对参考序列进行选择性剪接位点的预测。参赛者可以选择不同或多个算法进行比对。
3.对预测出的选择性剪接位点进行验证和筛选，剔除假阳性数据。
4.对筛选得到的选择性剪接位点进行序列特征分析，包括保守性分析、功能域预测、结构域分析等。
5.将分析结果进行比对和统计，并进行数据可视化处理，进一步展示预测结果。
参赛者需要在规定时间内提交任务报告，报告中需要包含以下内容：
1.分析方法和流程的详细描述，包括选择性剪接位点预测、数据处理及分析。
2.实验结果及分析，包括选择性剪接位点的预测结果、分析结果和统计结果等。报告中应有图表和数据统计，数据要具有可重现性和可解释性。
3.实验评估和结论，包括对选择性剪接位点预测的准确度、可靠性和适用性的评估，并对所得出的结论和未来研究方向进行讨论。
任务要求：
1.参赛者需具备生物信息学和统计学基础知识，特别是选择性剪接相关的基础知识。
2.参赛者需具有较强的分析和解决问题的能力，能够独立思考并解决实验中遇到的问题。
3.参赛者需要使用Python、R、Perl或其他编程语言完成数据处理和分析，需要掌握基本的编程技能和工具。
4.参赛者需要有良好的英语阅读能力，能够阅读和理解相关文献和资料。
5.参赛者需遵守学术诚信和质量要求，保证实验结果的可靠性和准确性。
任务时间和提交要求：
1.任务时间：本次任务的时间周期为两个月，包括任务接收，实验操作，报告撰写等。具体时间安排见比赛规则。
2.提交要求：参赛者需按照要求提交任务报告和程序代码。报告实验结果应当经过详细分析和总结，并能够清晰地表达实验的思路和方法。程序代码应当易于阅读和理解，可以提供必要的注释。报告和代码应当提交到指定的网络平台或邮箱，提交截止时间见比赛规则。
任务评估标准：
1.实验设计和方案的完整性和准确性。
2.数据处理和分析的方法和准确性。
3.实验结果的可重现性和表达力。
4.报告结论的条理性和可解释性。
5.代码的规范性和易读性。
任务成果：
1.将所有任务成果提交至指定平台或邮箱中。
2.任务成果包括：实验报告、数据分析结果、程序代码等。
3.经过初步筛选的参赛者，将需要进行答辩或其他进一步评估。