小桐子SSR分子标记的开发与种质遗传多样性分析的任务书.docx

小桐子SSR分子标记的开发与种质遗传多样性分析的任务书
任务书
任务概述：
本任务的目的是对小桐子（Phyllostachysedulis）的分子标记进行开发和分析其种质遗传多样性，为小桐子的进一步研究和应用提供基础性数据支撑。任务主要分为三个方面：
1.小桐子SSR分子标记的开发
2.小桐子的种质遗传多样性分析
3.结合两个方面的分析结果，探讨小桐子种质资源的利用价值和品种改良方向。
任务内容：
1.小桐子SSR分子标记的开发
首先，根据小桐子的基因组组成和序列信息，确定SSR分子标记的选择和设计原则，选取合适的核酸片段进行扩增、纯化、测序和分析。开发得到的SSR分子标记需要进行验证和评估，包括降聚态、规模多态性、多倍体性检测等方面的评估。
2.小桐子的种质遗传多样性分析
对收集的小桐子种质资源进行鉴定、分类和筛选，选取代表性种质建立资源库。对建库的种质进行分子分型，使用SSR分子标记进行多倍体鉴定、基因型分析，计算不同单倍型之间的遗传相似性指数，构建群体遗传多样性指标体系。然后，对小桐子种质的群体分化和遗传结构进行分析。
3.结合两个方面的分析结果，探讨小桐子种质资源的利用价值和品种改良方向。
根据SSR分子标记的遗传距离和种质资源的分类结果，结合小桐子的品种特点，探讨小桐子种质资源在不同领域的利用价值，如林业、食品等领域的应用。同时根据分析结果，提出小桐子品种改良的方向和策略，为小桐子的品种改良和质量提升提供科学支撑。
任务计划：
1.第一阶段（3个月）：小桐子SSR分子标记的开发
-确定分子标记选择和设计原则
-优化PCR扩增和电泳分析条件
-对开发得到的分子标记进行验证和评估
2.第二阶段（6个月）：小桐子的种质遗传多样性分析
-对收集的小桐子种质资源进行鉴定、分类和筛选
-利用已开发的分子标记进行多倍体鉴定和基因型分析
-计算遗传相似性指数和组群遗传多样性指标
3.第三阶段（3个月）：结合分析结果，探讨小桐子种质资源的利用价值和品种改良方向
-根据遗传距离和分类结果结合小桐子品种特点，探讨种质资源的应用价值
-根据分析结果，提出小桐子品种改良的方向和策略
任务成果：
1.开发得到新的小桐子SSR分子标记，并进行了初步的验证和评估。
2.建立小桐子种质资源库，并对其进行群体遗传多样性和种质分类分析。
3.探讨小桐子种质资源的利用价值和品种改良方向，为小桐子的进一步研究和应用提供科学支撑。
预算：
1.仪器材料费：10000元
2.工作人员费用：20000元
3.实验室管理费：5000元
总计：35000元
参考文献：
1.YuanL,LiuB,ZhangN,etal.Geneticdiversityandpopulationstructureofmosobamboo(Phyllostachysedulis)asrevealedbySSRmarkers.BiochemGenet,2015,53(3-4):71-83.
2.WangJ,ZhangL,XuX,etal.Thegeneticdiversityandpopulationstructureofmosobamboo(Phyllostachysedulis)inChinarevealedbySSRmarkers.Genetica,2012,140(1-3):75-81.
3.孔维良,莫宗政,李烁,等.小桐子(Phyllostachysedulis)遗传多样性分析[J].西南林学院学报,2007,27(2):36-40.