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两份水稻品种抗褐飞虱遗传分析及Bph36(t)的精细定位的开题报告
一、研究背景
水稻是世界上最重要的粮食作物之一，在全球范围内被广泛种植和消费。然而，水稻的生产面临着各种外部和内部的威胁，其中包括害虫的攻击。褐飞虱是水稻生产中最严重的害虫之一，它不仅直接咬食水稻叶片造成损失，而且还会传播病毒病害。
为了保障水稻产量和质量的稳定提升，培育高效抗褐飞虱的水稻品种是非常必要的。在过去的几十年里，许多科学家和农民一直致力于研究水稻品种对褐飞虱的抗性。然而，由于褐飞虱适应性强，具有很强的适应性和变异性，目前还没有开发出能够完全抗击褐飞虱的水稻品种。
因此，本文旨在选取两个水稻品种进行抗褐飞虱的遗传分析，以期研究出相关的遗传标记和抗褐飞虱的关键基因，从而为培育高效抗虫的水稻品种提供有益的参考。
二、研究内容
1.实验材料
本实验选取两个具有抗褐飞虱特点的水稻品种作为材料，分别是“IRRI146”和“IR64”。它们分别来源于于菲律宾国际稻米研究所和国际水稻研究中心。经过长期的育种和选育，它们都表现出了明显的抗虫特性。同时，还选取一些普通的水稻品种作为对照组，这些品种未表现出抗虫的特性。
2.实验设计
本实验采用了全基因组扫描方法，在两个水稻品种中筛选抗褐飞虱相关的遗传标记和关键基因。具体实验流程如下：
（1）提取水稻DNA并进行测序：将水稻品种的DNA样本分别提取出来，采用IlluminaHiseq2500测序仪进行测序，得到高质量的DNA序列数据。
（2）基因组扫描筛选遗传标记：利用SNP和SSR标记技术对测序数据进行分析和筛选，鉴定出和抗褐飞虫相关的遗传标记。
（3）遗传连锁图谱构建和QTL分析：采用明胶电泳方法对筛选出的遗传标记进行测定，并利用构建的遗传连锁图谱和QTL分析技术，对确定抗虫基因的位置和相关性进行分析和研究。
（4）基因精细定位：基于已经确定的抗褐飞虫关键基因，采用插入/删除标记技术和同源序列比较方法对关键基因进行精细定位。
3.预期结果
本实验旨在筛选出两个水稻品种中和抗褐飞虫相关的遗传标记和关键基因，并通过遗传连锁图谱构建和QTL分析，确定抗虫基因的位置和相关性。预计本实验能够达成以下目标：
（1）筛选出具有显著遗传指标的SNP和SSR标记，为抗褐飞虫基因的定位提供核心参考。
（2）明确抗虫相关的QTL定位，进一步解析差异性。
（3）通过插入/删除标记技术和同源序列比较方法，对关键基因进行精细定位，进一步确定基因的位置和功能，为高效抗虫的水稻品种的培育提供理论依据和技术支持。
三、研究意义
本研究对于水稻抗虫育种具有重要的意义。一方面，通过多角度的遗传分析和图谱构建，可以更加准确地对水稻品种的抗虫特性进行评价和比较，为优质抗虫的水稻品种的筛选和培育提供有效的策略和方法。另一方面，本研究的成果可以为控制和防治水稻病虫害提供重要的理论与技术支持。
同时，本研究还为遗传学和发育生物学等领域的研究提供了新的思路和方法。通过对水稻遗传特性的探索和分析，可以更好地理解和研究物种的进化和遗传机制。此外，本研究采用国际上最先进的遗传测序技术，为今后类似研究提供了技术基础和标准流程。
总之，本研究在水稻抗虫育种及相关领域有着积极的影响和作用，具有广泛的应用前景。