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细菌中人工设计反式作用非编码小RNA筛选模型的建立的任务书 任务书:细菌中人工设计反式作用非编码小RNA筛选模型的建立 背景: 非编码RNA(ncRNA)是一类不编码蛋白质的RNA分子。在细胞内,ncRNA担任着多种生物过程的调控角色,如基因表达、细胞分裂、DNA修复等。近年来,研究发现ncRNA具有类似天然miRNA的作用,参与到基因表达调控中,形成调控网络,调控分子如RNA、DNA和蛋白质在细胞内的水平和位置。在细菌中,反式作用小RNA(asRNA)作为一类特殊的非编码小RNA,在调控转录因子和全局调控方面发挥着重要作用。 任务: 本任务旨在建立一种细菌中人工设计反式作用非编码小RNA筛选模型。任务的具体内容如下: 1.了解并掌握反式作用小RNA及其在细菌中的作用机制 2.研究国内外的反式作用小RNA筛选模型及其优缺点,并探究适合本研究的筛选模型技术 3.搜集和整理已有的有关反式作用小RNA的基因序列和相关文献资料,以此作为本次筛选研究的数据来源 4.对以上资料进行处理,建立反式作用小RNA筛选模型,并优化模型 5.实验验证建立的模型的可靠性和有效性,并对筛选结果进行数据分析 6.对此次筛选研究的实验设备和技术进行验证和评估,总结经验并提出改进建议 目标: 通过本次任务的完成,达到以下目标: 1.建立可靠、有效的反式作用小RNA筛选模型,能够对细菌中的asRNA进行筛选和分析 2.为细菌中的asRNA研究提供参考和指导 3.推广使用本模型,促进非编码RNA研究的发展 时间安排: 本次任务的时间安排如下: 第一周:了解反式作用小RNA及其在细菌中的作用机制,搜集并整理文献与数据资料 第二周:研究国内外的反式作用小RNA筛选模型及其优缺点,探究适合本研究的筛选模型技术 第三周:根据以上资料建立反式作用小RNA筛选模型,并优化模型 第四周:实验验证建立的模型的可靠性和有效性,并对筛选结果进行数据分析 第五周:对此次筛选研究的实验设备和技术进行验证和评估,总结经验并提出改进建议 结果报告: 本任务的结果报告应包括以下内容: 1.反式作用小RNA的作用机制及其在细菌中的应用背景 2.相关文献和数据资料的搜集与整理 3.建立的反式作用小RNA筛选模型及其优化 4.实验验证数据及结果分析 5.对实验设备和技术的评估与改进建议 6.结果分析、结论讨论及其对非编码RNA研究的意义 建议参考文献: 1.ConnellyCM,etal.Genome-wideidentificationofasRNAtargetsusingResampling-basedInferenceofasRNAEnrichment(RIE). 2.BureninaOY,etal.AntisenseRNAscanregulategeneexpressioninbacteria.FrontMicrobiol.2018;9:46. 3.WangM,etal.IdentificationandcharacterizationofncRNAsbyanovelcomputationalmodel. 4.WrightPR,etal.RNAmappingandanalysisofncRNAs.NatProtoc.2017;12(4):635-646.