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NO对莲雾果实采后絮状绵软进程影响的转录组学研究的任务书
任务书
题目：对莲雾果实采后絮状绵软进程影响的转录组学研究
背景：
莲雾（W.formosana）是一种热带果树，广泛分布于中国东南部、印度尼西亚、马来西亚、菲律宾、泰国等地。莲雾果实有特殊的风味和口感，含有大量的营养成分，是一种非常受欢迎的水果。
然而，由于其果实采后易产生“絮状绵软”现象，导致果实表皮表现出极度的柔软及粘性，严重影响果实的商业价值。目前关于莲雾果实采后絮状绵软的机理及其影响因子的研究非常有限，因此本次研究旨在通过转录组学方法探究莲雾果实采后绵软进程的影响因素，以期为其后续保鲜和贮藏提供科学依据。
任务目标：
通过转录组学研究莲雾果实采后绵软进程的影响因素，鉴定相关转录因子的表达差异，并探究其调控网络及功能富集。
任务内容及进度安排：
1.莲雾采后残留劣质酸处理，建立单实验组（绵软果实）及对照组（正常果实）。
2.果实RNA提取、建库、定量和质量检测。
3.Illumina平台高通量测序，测序质量评估及序列拼接。
4.进行基因注释和生物信息学分析，鉴定差异表达基因（DEGs）及调控因子。
5.基于DEGs进行GO和KEGG富集分析，包括分子功能、生物过程、细胞组分等。
6.构建差异基因的转录因子——靶基因网络，并进行关键调控因子分析。
7.结合对采后绵软进程的控制方式，研究差异基因的功能和可能的调控机制。
8.编写实验报告，撰写研究文章。
计划时间表：
第一阶段（3-4周）：
1.提取莲雾果实RNA，建立单实验组及对照组。
2.进行RNA定量和质量检测。
第二阶段（4-5周）：
1.建立转录组测序文库，进行高通量测序。
2.进行测序质量评估和序列拼接。
第三阶段（2-3周）：
1.完成基因注释和生物信息学分析。
2.鉴定差异表达基因及调控因子。
第四阶段（2-3周）：
1.进行GO和KEGG富集分析。
2.构建差异基因的转录因子——靶基因网络，并进行关键调控因子分析。
第五阶段（2-3周）：
1.结合对采后绵软进程的控制方式，研究差异基因的功能和可能的调控机制。
2.编写实验报告，并撰写研究文章。
参考文献：
1.黄晓安，陈煜，杨秉毅，等.莲雾果实的采后特性及其分子机制研究进展[J].园艺学报，2017，44（3）:547-557.
2.朱凯华，林涛，吴维平，等.莲雾果实采后发育生理和品质变化的研究进展[J].南方农业学报，2017，48（6）:933-938.
3.卢燕燕，李春梅，朱丽华，等.莲雾果实采后生理与品质的变化[J].广西农业科学，2018，49（4）:460-466.