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基于发夹探针基因突变点分析与DNA修饰检测小分子的任务书 任务书:基于发夹探针基因突变点分析与DNA修饰检测小分子 任务背景: 生物医学研究中,对基因突变点的检测和DNA修饰的分析是非常重要的研究内容。基因突变点的检测可以用于诊断遗传性疾病,预测疾病发生的风险,评估药物疗效等;而DNA修饰的分析则可以揭示许多疾病的发生机制,如癌症等。目前,发夹探针技术和质谱分析技术都已经被广泛应用于基因突变点的检测和DNA修饰的分析。 任务描述: 本次任务旨在基于发夹探针技术和质谱分析技术,设计实现基因突变点分析和DNA修饰检测的小分子。具体要求如下: 1.设计发夹探针 根据目标基因的序列设计合适的发夹探针,包括正向和反向探针。要求探针序列特异性高,能够在PCR扩增反应中特异性地结合目标DNA序列。探针的设计应考虑到PCR后测序的方便性和准确性,并选取合适的测序区域。 2.实现PCR扩增反应 在探针设计完成后,利用PCR扩增技术进行反应,实现对目标基因的选择性扩增。要求PCR反应条件准确、稳定,探针特异性高。 3.质谱分析 在PCR扩增反应完成后,对目标基因进行质谱分析。要求分析准确、灵敏度高、可靠性好。采用质谱分析技术对PCR产物进行分析,检测目标基因的突变点。 4.DNA修饰检测小分子 利用质谱分析技术对小分子进行检测,对目标基因的DNA修饰进行分析。要求分析灵敏度高、准确性好。采用锁定区碎片电泳技术对小分子进行分析。 任务计划: 本次任务的计划分为三个阶段,如下: 第一阶段(7天): 熟悉任务内容、调研市场现状和技术方案,完成发夹探针的设计。 第二阶段(15天): 搭建PCR反应体系,完成PCR扩增反应,对产物进行测序并进行质谱分析。 第三阶段(10天): 对小分子进行分析,实现DNA修饰检测。 任务要求: 1.实验操作规范,保证实验结果的准确性和可靠性。 2.实验过程中应注意试剂的质量、数量和保存条件。 3.合理分配时间和资源,按时完成各个阶段任务。 4.组织撰写实验报告,对实验过程和结果进行详细的记录和解释。 参考文献: 1.Li,J.,&Wang,L.(2019).LockingnucleicacidannealedtotwoDNAprobesforsensitivesmallmoleculedetection.Analyst,144(6),1888-1894. 2.Fu,D.Y.,Zhang,J.J.,He,Y.,Wang,P.L.,Lv,Z.Q.,Wei,P.,&Jin,W.L.(2020).Predictinganewprostatecancersusceptibilitygeneusingcombinationoffunctionalgenomicsandmachinelearningmethods.Aging,12(22),22996. 3.Komatsu,A.,Tsuchiya,A.,&Kajihara,Y.(2014).MassspectrometricanalysisofDNAadducts.Journalofpharmaceuticalandbiomedicalanalysis,87,276-285.