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水牛抑制素α基因RNAi载体构建与沉默效率检测的任务书 一、任务概述 RNA干扰技术是一种通过设计和合成靶向特定基因的小分子RNA从而沉默目标基因的方法。在许多生物学领域,RNAi技术已经成为可靠的基因沉默方法。本次任务旨在构建hhOWM9SiRNA载体,并通过体外及体内实验检测其对水牛抑制素α基因的沉默效率。 二、任务背景 水牛抑制素α(Buffaloin)是一种天然的杀虫激素,与昆虫EEG抑制素(InsectEcdysisTriggeringHormone,ETH)同源。研究发现,通过沉默水牛抑制素α基因可以有效控制吸血虫的寄生和繁殖,因此该技术在水牛产业及医学领域具有重要应用价值。 三、任务内容 1.设计siRNA序列 根据水牛抑制素α基因的序列信息,设计两个siRNA序列。从已有文献中筛选出靶向水牛抑制素α基因的siRNA序列,经过BLAST比对和评估,最终获得两个siRNA序列,以便进行后续实验。 2.构建hhOWM9SiRNA载体 在已有的基础上,选择hhOWM9载体作为模板,将双链siRNA序列插入到载体中。首先将siRNA序列合成,并通过PCR扩增得到带有限制酶切位点的DNA片段,然后将该片段与载体线性化后进行连接,最终得到hhOWM9SiRNA载体。 3.制备体外转染复合物 采用聚乙烯亚胺(PEI)作为载体,与hhOWM9SiRNA载体形成复合物为细胞提供siRNA递送。将hhOWM9SiRNA载体与PEI混合,通过离心法制备体外转染复合物并进行质粒的纯化。 4.体外转染效率检测 将制备好的复合物用于转染HEK293T细胞,通过荧光显微镜观察细胞内荧光素的表达和RNA水平的检测,评估hhOWM9SiRNA载体在体外下的转染效率。 5.体内实验 6.1动物实验 将hhOWM9SiRNA载体通过尾静脉注射进入雄性小鼠,并测定其鼠体内BuffaloinmRNA水平的变化情况以检测hhOWM9SiRNA的体内效果。 6.2细胞培养实验 将hhOWM9SiRNA载体转染入C6glioma细胞,测定细胞内BuffaloinmRNA水平的变化情况,进一步测试hhOWM9SiRNA的体内效果。 四、任务进展计划 1.设计siRNA序列,完成BLAST比对和评估。(1天) 2.构建hhOWM9SiRNA载体,纯化质粒。(3天) 3.制备体外转染复合物,进行RNA测序和荧光分析。(1周) 4.完成动物实验,测定鼠体内BuffaloinmRNA水平的变化情况,检测hhOWM9SiRNA的体内效果。(2周) 5.完成C6glioma细胞实验,测定细胞内BuffaloinmRNA水平的变化情况,检测hhOWM9SiRNA的体内效果。(2周) 6.对结果进行汇总分析,撰写实验报告。(2周) 五、任务要求 1.具备分子生物学实验技能和动物实验经验; 2.熟悉RNAi技术原理和流程,具有人工合成siRNA经验; 3.熟练掌握DNA克隆技术,具有PCR扩增和质粒纯化的经验; 4.对体外和体内实验经验较为充分,能够严格控制实验前后的环境,进行数据分析、处理等统计工作; 5.沟通能力和团队合作精神较强,能够与他人进行有效交流和协作。