不结球白菜分子遗传图谱构建及数量性状位点分析的开题报告.docx

不结球白菜分子遗传图谱构建及数量性状位点分析的开题报告
一、研究背景
不结球白菜，又称为非洲菜、带杆菜等，是一种重要的蔬菜作物，在市场上受到广泛的欢迎。然而，在不结球白菜的生产过程中，由于数量性状的影响，使得其产量和品质存在较大的差异。因此，通过分子遗传学研究不结球白菜的数量性状，旨在为不结球白菜的高产、高质量生产提供理论依据。
二、研究目的
1.构建不结球白菜分子遗传图谱；
2.分析不结球白菜数量性状相关的遗传基础；
3.挖掘不结球白菜数量性状的关键基因，为品种改良提供基础。
三、研究内容
1.不结球白菜基因组的DNA提取与测序；
2.数据清洗和质量控制，建立不结球白菜基因组参考序列；
3.不结球白菜分子遗传图谱的构建，包括单核苷酸多态性（SNP）标记的筛选和建立；
4.不结球白菜数量性状的分离和测定，包括株高、叶片数量、叶面积、叶片厚度等指标；
5.不结球白菜数量性状位点的分析，包括定位、鉴定和验证。
四、研究方法
1.DNA提取：采用高品质的不结球白菜新叶，利用CTAB方法快速提取基因组DNA。DNA质量检测和测序。
2.数据清洗：利用QualityControl（QC）软件进行数据清洗，去除低质量序列、接近期末端和低复杂度序列等。
3.SNP标记的筛选和建立：利用GATK软件分析测序数据，筛选SNP，并利用AFLP和RAPD等标记建立不结球白菜遗传图谱。
4.数量性状的测定：采用EcoCI增殖方法测定四项数量性状，即株高、叶片数量、叶面积和叶片厚度。统计数据并进行方差分析。
5.位点分析：采用QTL分析和GWAS分析相结合的方法，对数量性状位点进行分析和定位，并进行验证。
五、预期成果
1.不结球白菜的分子遗传图谱，包括SNP和AFLP、RAPD等标记的图谱；
2.不结球白菜数量性状的分离和测定数据；
3.关键基因分析和验证结果。
六、论文结构
1.绪论：包括不结球白菜的研究背景和目的；
2.研究方法：包括实验设计、DNA提取和测序、标记筛选和定位分析等内容；
3.结果：包括分子遗传图谱、数量性状数据和分析结果；
4.讨论：对结果进行解释和分析；
5.结论和展望。
七、研究进展
目前，已完成DNA提取和测序，数据清洗和质量控制，并初步筛选出SNP标记。正在进行标记的建立和数量性状的测定。