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基于复杂网络预测MIRI中药复方作用靶点的研究的中期报告
尊敬的评委和老师们，大家好！我今天的报告是基于复杂网络预测MIRI中药复方作用靶点的研究的中期报告。
首先，我简单介绍一下研究背景和意义。传统中药的药效研究存在着多靶点、多成分、多途径的复杂性，因此如何快速而准确地预测中药复方的作用靶点，成为了近年来中药研究的热点问题。基于网络的方法因其能够反映系统中复杂的相互作用关系而备受关注，已经被广泛应用于中药复方的研究。MIRI（模拟多元互作）是近年来提出的一种展现多元组合作用模式的方法，能够更好地反映中药复方的多成分、复杂作用机制。
因此，本研究旨在利用MIRI方法，建立复杂网络模型，预测并筛选MIRI中药复方的作用靶点，为中药的药理研究提供理论支持和实验方向。目前为止，我已经完成了以下工作。
首先，我根据相关文献，收集并整理了35个含有相关药理活性的MIRI中药复方以及其成分信息。接着，我利用STRING数据库，筛选并整理了这些药物的蛋白质互作网络，包括5623个蛋白质和19678个相互作用关系，构建初始复杂网络。
在此基础上，我采用Cytoscape软件对构建的复杂网络进行分析，发现该网络是一个典型的小世界网络，具有高聚集性和短路径特性。接着，我利用网络分析的方法，从网络结构和拓扑特性等角度出发，对MIRI中药复方的作用机制进行了深入研究，发现有些蛋白质在网络中具有重要的中心性和关键性，这些蛋白质可能是该复方的作用靶点。同时，我还采用各种算法对网络结构进行了进一步分析和筛选，确定了预测作用靶点的候选名单。
目前为止，本研究已经取得了初步进展，但还存在以下问题和不足。首先，由于人体机体的复杂性，中药复方的药理作用机制也非常复杂，本研究目前只考虑了蛋白质在复杂网络中的作用，并未考虑其他因素的影响。其次，本研究中所使用的网络分析方法和数据分析方法还需要进一步完善和提高准确性。未来，我将继续深入探究，完善实验设计和数据采集，争取在本领域取得更好的研究结果。
感谢各位评委和老师们的聆听！