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麻疯树盐胁迫响应基因分析和三个硫酯酶类基因初步研究的中期报告
本研究以海滨麻疯树为材料，利用IlluminaHiSeqXTen平台对其盐胁迫响应基因进行了分析，并初步研究了三个硫酯酶类基因。以下为中期报告：
1.麻疯树盐胁迫响应基因分析
经过数据预处理和质量控制，共获得麻疯树盐胁迫前后两个时间点的转录组测序数据。使用Trinity软件拼接得到313,807个转录本，经CD-HIT筛选后得到133,305个unigene。
通过比对到NCBINr、Swissprot、KEGG、KOG、GO数据库，共识别出52,691个unigene的注释信息，其中27,758个unigene注释到至少一个数据库，37,421个unigene有GO注释。注释结果显示主要涉及胁迫响应、转录调控、信号传导、氧化还原、蛋白质代谢等生物学过程。
进一步筛选出差异表达基因（DEGs），共识别出1955个基因在盐胁迫后显著差异表达，其中1459个基因上调表达，496个基因下调表达。KEGG通路分析显示上调基因主要涉及生物合成、信号传导和代谢途径，下调基因主要涉及光合作用和二次代谢物合成。
2.三个硫酯酶类基因初步研究
通过比对NCBINr数据库和本实验室建立的麻疯树基因库，筛选出三个硫酯酶类基因，分别命名为TgEST089314、TgEST100683和TgEST105370。
比对结果显示，这三个基因与其他物种的硫酯酶类基因具有较高的同源性，并具有保守的酶活性位点和催化残基。表达谱分析显示，在不同组织和盐胁迫下，这三个基因的表达量存在差异。进一步推测它们可能参与麻疯树的氧化还原反应和代谢过程。
以上是本研究的中期报告。最终结果将进一步探讨麻疯树在盐胁迫下的响应机制和三个硫酯酶类基因的功能。