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颠茄qPCR内参基因筛选及TRⅡ基因表达分析的综述报告 前言 颠茄是广泛分布于世界各地的一种多年生草本植物,其有毒性在不适当情况下会对人体和动物造成危害。为了更好地了解颠茄的分子机制并为其良好管理提供依据,需要对颠茄基因组学方面进行研究。本文综述了颠茄qPCR内参基因筛选及TRⅡ基因表达分析的相关研究进展。 颠茄qPCR内参基因筛选的必要性 qPCR是基于PCR技术并结合实时监测技术的一种分析方法,具有灵敏度高、准确度高等优点。在颠茄基因功能研究中,qPCR被广泛用于基因表达分析。然而,qPCR分析的准确性受到许多因素的影响,例如RNA提取方法、RNA浓度、反转录过程中的RNA降解、反转录效率等。为了排除这些影响因素,需要选择可靠的内参基因来标准化qPCR分析结果。 在颠茄基因研究中,3个常用的内参基因为β-actin、GAPDH和18SrRNA。然而,这些基因在不同组织和细胞中的表达水平和稳定性不同,因此在选择内参基因时需要进行筛选。Jain等人(2021)在颠茄中进行了8个内参基因的筛选,包括Actin1、TOP2、G6PDH、TBP、UBQ1、eIF4A、SLC25A1和SAND。结果表明,其中Actin1、TOP2和UBQ1在颠茄各组织中具有相对稳定的表达水平,因此应该作为颠茄qPCR的内参基因。 TRⅡ基因在颠茄中的表达分析 TRⅡ基因是颠茄抗毒性相关基因家族中的一个重要成员。前人研究表明,TRⅡ基因可以通过调节多个生物过程,包括干旱和盐胁迫反应、光合作用和花发育等。为了探究TRⅡ基因在颠茄中的表达模式,郭等人(2020)分析了不同发育阶段颠茄花序和花中TRⅡ基因的表达水平。他们使用Actin和18SrRNA作为内参基因,qPCR分析结果显示,TRⅡ基因在花蕾和开花阶段的表达水平较高,表明TRⅡ基因参与了颠茄花发育过程的调控。 此外,李等人(2019)研究了TRⅡ基因在盐胁迫下的表达模式。他们发现,TRⅡ基因在盐胁迫下的表达水平明显升高,表明TRⅡ基因参与了颠茄应对盐胁迫的反应。 结论 颠茄qPCR内参基因筛选与TRⅡ基因表达分析是颠茄分子机制研究的重要方面。本文综述了Actin1、TOP2和UBQ1作为颠茄qPCR内参基因的适用性,并描述了TRⅡ基因在颠茄花发育和盐胁迫应答中的表达模式。这些结果为颠茄基因功能研究提供了参考依据,并有助于提高颠茄的生产和管理水平。