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MicroRNA2032调控短柄草开花时间的分子机制研究的中期报告 本研究旨在探究microRNA2032(miR2032)在短柄草(Brachypodiumdistachyon)开花时间调控中的分子机制。目前已经完成了实验材料的选取、实验方案的设计、样本采集和RNA测序等工作,以下为中期报告。 一、实验材料的选取 本研究选择短柄草作为研究对象,主要基于以下两个原因: (1)短柄草为一种模式植物,广泛应用于植物学研究中。 (2)短柄草花期短(约为两个月),适合进行开花时间调控的分子机制研究。 二、实验方案的设计 在本研究中,选择与开花相关的miRNA和mRNA进行测序,以揭示miR2032参与开花调控的分子机制。具体方案如下: (1)分别从短柄草采集未成熟花序和开花后12天的花序样本。 (2)对样本进行RNA提取,构建miRNA和mRNA文库,并对其进行Illumina测序。 (3)对测序数据进行质控和过滤,得到高质量的数据。 (4)使用Bowtie软件将数据比对回参考基因组,确定不同ially表达的miRNA和mRNA。 (5)对差异表达miRNA和mRNA进行GO和KEGG富集分析,筛选出与开花相关的miRNA和mRNA。 三、样本采集和RNA测序 在本研究中,共采集了短柄草未成熟花序和开花后12天的花序样本各3个,分别用于miRNA和mRNA文库的构建和测序。随后,使用IlluminaHiSeq2500平台对文库进行高通量测序,得到了大量的RNA测序数据。 四、分析结果 经过质控和过滤后,得到了高质量的miRNA和mRNA测序数据。使用Bowtie软件将数据比对回参考基因组后,得到了不同ially表达的miRNA和mRNA信息。 对差异表达miRNA和mRNA进行GO和KEGG富集分析后,筛选出了与开花相关的miRNA和mRNA。其中,miR2032被发现与开花相关,可能参与了开花时间的调控。 五、下一步研究计划 在接下来的研究中,将进一步验证miR2032调控短柄草开花时间的作用,并探究其分子机制。同时,还将进行qRT-PCR和原位杂交等实验检验miR2032的表达水平和作用方式,以期揭示其在开花调控中的具体作用。