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羊草抗逆相关DREB转录因子及SAMDC基因功能研究的中期报告
本研究的目的是通过分析羊草（Leymuschinensis）在不同抗逆条件下并使用转录组技术筛选出相关的DREB转录因子和SAMDC基因，进一步探究它们在抗逆过程中的功能。以下是中期报告的主要内容：
一、实验设计
1.1样品处理
收集羊草生长状况良好的植株，分为对照组和处理组。对照组在常规环境下生长，处理组分别暴露在低温、干旱和盐胁迫条件下。
1.2转录组测序
将对照组和处理组的根、茎和叶样品分别提取RNA，进行测序，得到转录组数据。
1.3数据分析
使用Trinity软件对测序数据进行组装，利用DESeq2软件进行差异表达基因筛选和GO功能注释。
二、实验进展
目前，我们已经完成了样品处理和转录组测序工作，并对测序数据进行了初步的分析。通过差异表达分析，共筛选出了400个响应低温、800个响应干旱和600个响应盐胁迫的基因。进一步进行GO注释，发现这些基因涉及到许多生理生化过程。
同时，我们对部分差异表达的DREB转录因子和SAMDC基因进行了实时荧光定量PCR验证，初步证实它们在抗逆过程中发挥着重要的功能。
三、下一步工作计划
接下来，我们将继续深入分析筛选出的差异表达基因，挖掘其调控网络和生物学意义。同时，我们还将进行基因敲除或过表达实验，验证DREB转录因子和SAMDC基因在羊草抗逆过程中的具体作用。