紫花苜蓿不育系与保持系线粒体全基因组比较分析.docx

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紫花苜蓿不育系与保持系线粒体全基因组比较分析
目录
一、内容概述................................................3
1.研究背景与意义........................................4
2.国内外研究现状........................................5
3.研究内容与方法........................................6
二、实验材料与方法..........................................7
1.实验材料..............................................8
不育系与保持系的选取..................................10
线粒体DNA的提取.......................................11
2.实验方法.............................................12
基因组提取与测序......................................13
数据处理与比对........................................14
相关性分析与差异表达..................................15
三、线粒体基因组结构与功能分析.............................16
1.线粒体基因组特征.....................................17
基因数量与组成........................................18
线粒体基因组大小......................................19
2.功能注释.............................................20
COX1基因序列分析......................................21
ND4L基因序列分析......................................21
ATP6基因序列分析......................................22
3.系统发育树构建.......................................24
不同物种间线粒体基因组的比较..........................25
不同不育系与保持系间的系统发育关系....................26
四、线粒体基因组差异分析...................................27
1.基因突变分析.........................................28
突变位点统计..........................................29
突变类型分布..........................................30
2.基因表达差异分析.....................................32
调节元件分析..........................................33
基因表达量对比........................................34
五、不育系与保持系线粒体功能差异分析.......................35
1.线粒体代谢途径分析...................................36
氧化磷酸化途径........................................38
线粒体DNA复制与修复途径...............................39
2.线粒体能量转换分析...................................40
水平转移酶活性分析....................................41
解偶联蛋白活性分析....................................42
六、结论与展望.............................................43
1.结论总结............................................