异源四倍体鲫鲤BAC文库的构建及其功能基因的遗传变异分析的中期报告.docx

异源四倍体鲫鲤BAC文库的构建及其功能基因的遗传变异分析的中期报告
在本研究中，我们对异源四倍体鲫鲤进行了BAC文库的构建，并对文库中的功能基因进行了遗传变异分析。具体工作如下：
一、BAC文库的构建
1、DNA提取
我们从异源四倍体鲫鲤体内提取高品质的基因组DNA，以作为构建BAC文库的模板。提取DNA的方法基于常规的CTAB法。
2、BAC文库构建
我们采用标准的BAC克隆构建方法，将DNA片段克隆至BAC载体中，并通过电穿孔法将BAC克隆子导入大肠杆菌DH10B中。经过筛选和检验，我们共得到了100,000个BAC克隆子。
二、功能基因的遗传变异分析
1、文库筛选
我们首先对BAC文库中的克隆子进行筛选，选择与鲫鲤气候适应有关的功能基因克隆子作为研究对象。
2、克隆子测序
我们使用Sanger测序技术对选定的BAC克隆子进行测序，得到了序列信息。
3、基因注释
我们使用BLAST和其他基因注释工具对序列信息进行注释，鉴定其中的功能基因。
4、遗传变异分析
我们获取了不同鲫鲤品系的基因序列，并对不同品系之间的基因序列进行对比分析，检测其遗传变异信息。
目前，我们已经完成了BAC文库的构建和部分克隆子的测序和遗传变异分析工作，我们将继续进行后续工作，包括完整的文库筛选和更多基因的测序和遗传变异分析。该研究有望为鲫鲤的气候适应研究提供新的数据和证据。