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盐芥蛋白质组学研究的任务书
任务书
标题：盐芥蛋白质组学研究
背景：
盐芥（BrassicajunceaL.）是一种广泛种植的油菜作物，在全球范围内都有重要的农业和食品经济价值。同时，盐芥的营养成分也备受关注，其中蛋白质是盐芥营养价值的重要组成部分。目前，随着蛋白质组学技术的发展和应用，研究盐芥蛋白质组学已经成为一个热点领域。通过对盐芥蛋白质组的研究，可以揭示盐芥蛋白质在抗逆性、营养特性等方面的机理，从而为盐芥作物的选育和改良提供科学依据。
任务：
本次研究旨在利用蛋白质组学技术，建立盐芥蛋白质组谱库，并对其进行分析和比较，揭示其在不同条件下的差异表达情况以及生物学功能。具体任务如下：
1.收集盐芥不同生长时期和环境条件下的样品，包括不同组织和器官的样品；
2.提取样品中的蛋白质，进行SDS-PAGE或2-DE电泳分离，并用质谱技术进行鉴定和分析；
3.建立盐芥蛋白质组谱库，包括蛋白质的组成、数量、结构、功能等信息，并进行数据库管理和维护；
4.对盐芥蛋白质组谱库进行分析和比较，揭示在不同生长时期、环境条件和组织器官等方面的差异表达情况，并进行生物学功能和途径分析；
5.利用生物信息学工具，对盐芥蛋白质组谱库进行注释和联合分析，找出与盐芥逆境响应、营养、生长发育等相关的蛋白质，探索盐芥蛋白质组在生物学功能上的规律性；
6.撰写研究报告，总结盐芥蛋白质组学研究的主要结果和发现，并对盐芥蛋白质组学的应用前景进行展望。
计划时间：
本研究预计需要12个月的时间，具体时间节点如下：
月份计划任务
1-2收集盐芥样品，准备实验设计和方案
3-4蛋白质提取和SDS-PAGE/2-DE电泳分离
5-6质谱鉴定和分析，建立盐芥蛋白质组谱库
7-8蛋白质组数据分析和比较
9-10生物信息学分析和挖掘
11-12撰写研究报告
预算：
本研究预算为30万元，主要用于样品收集、实验材料和设备、质谱分析等方面的支出，具体预算分配如下：
项目预算（万元）
实验材料和设备10
样品收集和处理5
质谱分析和数据处理10
其他支出5
总计30
参考文献：
1.ZhangS,GuoL,SunH,etal.ComparativeProteomicAnalysisoftheResponsetoSaltStressinSalt-sensitiveandSalt-tolerantRice[J].JournalofProteomeResearch,2011,10(8):3852-3870.
2.DongX,JinM,WenF,etal.ComparativeProteomicAnalysisoftheResponsetoSaltStressinMutantandWild-typeEutremasalsugineum[J].JournalofProteomeResearch,2016,15(4):1245-1258.
3.LiH,YangY,ZhangS,etal.ComparativeProteomicsAnalysisRevealstheMechanismofSaltStressResponseinBrassicanapus[J].JournalofProteomeResearch,2016,15(1):465-476.