长江江豚的微卫星标记筛选与亲子鉴定研究的开题报告.docx

长江江豚的微卫星标记筛选与亲子鉴定研究的开题报告
一、课题背景与意义
长江江豚是中国特有的国家一级保护动物，也是世界上最濒危的淡水哺乳动物之一。由于多种因素的影响，长江江豚种群数量逐渐减少，目前仅存有约1000只左右。
为了更好地保护长江江豚，需要对其种群组成和基因多样性进行研究。微卫星标记是一种高变异性的分子标记，可用于种群遗传结构、亲子关系等的研究。因此，开展长江江豚微卫星标记筛选与亲子鉴定研究，有助于深入了解长江江豚种群的基因多样性和亲子关系，为其保护和繁殖提供科学依据。
二、研究内容与目标
研究内容：
1.长江江豚组织样本采集及DNA提取；
2.基于已有长江江豚微卫星标记文献，筛选适合本研究的微卫星标记；
3.微卫星PCR扩增、电泳检测并分型；
4.长江江豚的亲子关系鉴定。
研究目标：
1.筛选出适合本研究的长江江豚微卫星标记，建立物种特异性的微卫星标记库；
2.分析长江江豚种群的基因多样性和亲子关系，揭示其种群基因流动情况；
3.为长江江豚的保护和繁殖提供科学依据。
三、研究方法与步骤
1.长江江豚组织样本采集及DNA提取
本研究采用鳍切取法或肌肉组织切取法采集长江江豚的样本，并采用商业化DNA提取试剂盒进行DNA提取。
2.微卫星标记筛选与PCR扩增
本研究将在已有长江江豚微卫星标记文献的基础上，筛选具有较高多态性和物种特异性的微卫星标记并进行PCR扩增。PCR反应条件为：初始退火95℃，2min；40个循环（94℃，30s；Tm，30s；72℃，30s），最终延伸72℃，10min。
3.电泳检测并分型
PCR产物将进行聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）分离，以确认目标片段的纯度和扩增成功率，并进行分型分析。分析的工具为GeneMapper软件，通过碎片大小绘制荧光染料电泳图谱，进行微卫星基因型分型。
4.长江江豚的亲子关系鉴定
通过微卫星基因型比对，对长江江豚的亲子关系进行鉴定并绘制亲子图谱。同时，将采用STRUCTURE等软件对种群结构进行分析，探究不同群体之间的遗传关系和基因流动程度。
四、预期结果和意义
预期结果：
1.筛选出适合本研究的长江江豚微卫星标记，建立物种特异性的微卫星标记库；
2.揭示长江江豚种群的基因多样性和亲子关系，绘制长江江豚亲子图谱；
3.分析长江江豚不同群体之间的遗传关系和基因流动程度。
预期意义：
1.提高对长江江豚种群结构和基因多样性的认识，为其保护和繁殖提供科学依据；
2.建立物种特异性的微卫星标记库，为长江江豚的种群遗传学研究提供工具；
3.提高民众对长江江豚保护的认识和支持。