鳅超科鱼类若干基因的进化及分子系统发育分析的开题报告.docx

鳅超科鱼类若干基因的进化及分子系统发育分析的开题报告
开题报告
一、选题背景
鳅超科是淡水鱼类的一个重要类群，其具有重要的经济和生态价值。然而，鳅超科鱼类的系统分类学尚不清楚，对其进化关系和系统发育的认知也不够深入。为了更好地了解鳅超科鱼类的进化历程和系统分类学，本研究将选择若干基因进行分析，以期能够揭示其分子系统发育和进化关系。
二、研究内容和目的
本研究将选取鳅超科鱼类的若干基因进行进化分析，探讨其分子系统发育和分类学进化。具体内容包括：
1.收集相关文献和数据库，确定研究的鳅超科鱼类样本和基因序列；
2.对所选取的基因序列进行进化分析，包括构建基因家族、制作进化树，以及使用分子进化率等指标；
3.将所得结果与以往鳅超科鱼类的分类学研究成果相结合，对鳅超科鱼类的分类学地位和系统进化关系进行讨论。
本研究的目的在于了解鳅超科鱼类的分子系统发育和进化关系，为其分类学地位的确认和进化历程的探究提供参考。
三、研究方法和技术路线
1.数据采集：收集文献和数据库，筛选所需的鳅超科鱼类样本和基因序列。
2.进化分析：利用分子进化分析软件对所选取的基因序列进行进化分析，构建基因家族、制作进化树，使用分子进化率等指标。
3.数据分析：将所得结果与以往鳅超科鱼类的分类学研究成果相结合，对鳅超科鱼类的分类学地位和系统进化关系进行讨论。
四、预期结果和意义
本研究预计能够揭示鳅超科鱼类的分子系统发育和进化关系，为其分类学地位的确认和进化历程的探究提供参考。具体来说，预期结果包括：
1.揭示鳅超科鱼类各个属之间的亲缘关系和群体结构。
2.为鳅超科鱼类的分类学划分提供参考和依据。
3.为鳅超科鱼类的保护和利用提供科学依据。
五、进度安排
本研究的进度安排如下：
1.第一年
（1）科研调研和文献检索，确定所需样本和基因序列等；
（2）基因序列的扩增和测序工作；
（3）基因序列的质量检查和序列分析。
2.第二年
（1）进行系统发育重建和进化速率分析；
（2）分析结果的比对和解读；
（3）研究报告的撰写和初步成果汇报。
3.第三年
（1）研究结果细化和进一步分析；
（2）研究报告的修改和完善；
（3）撰写论文和完成论文答辩。
六、预计经费
本研究预计需要的经费主要包括：实验室材料费、算法软件购买费、文献检索费等。预计总经费为xx万元。
七、参考文献
1.Albertson,R.C.,Streelman,J.T.,Kocher,T.D.&Yelick,P.C.2005.Integrationandevolutionofthecichlidmandible:themolecularbasisofalternatefeedingstrategies.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciences,102(suppl1),16287-16292.
2.Bachtrog,D.,Kirkpatrick,M.,Mank,J.E.,McDaniel,S.F.,Pires,J.C.,Rice,W.&Wu,C.2009.Areallsexchromosomescreatedequal?TrendsinGenetics,25(5),204-211.
3.Ren,G.T.,Tan,M.,Yang,K.W.,Tao,Y.&Jiao,X.D.2018.ComparativeanalysisoforganellegenomesintwocloselyrelatedfishesoftheSinocyclocheilus(Cypriniformes:Cyprinidae)fromChinawithdifferentcaveadaptations.BMCevolutionarybiology,18(1),11.
4.Streelman,J.T.,Danley,P.D.&Bolnick,D.I.2018.EvolutionarydiversificationofAfricancichlids:sourcesofvariationinbodyshape,color,andtrophicecology.InAdvancesinMarineBiology.AcademicPress,59-112.
5.Wang,L.,etal.(2018).Comparativegenomicsrevealedgeneticdiversityandspeciesdifferentiationofgenesencodingcalliphorininthreeblowflies.ScientificReports,8,7433.