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. 实用文档. DNA拓扑异构酶综述 摘要:DNA拓扑异构酶为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称,是一种见于真核细胞和原核细胞中的重要生物酶,其对DNA转录、复制、染色体别离及基因表达等过程中的DNA拓扑结构起着重要的调控作用。研究发现,与正常细胞不同,DNA拓扑异构酶在肿瘤细胞中表现出不受其他因素影响的高水平表达,而许多抗肿瘤药物的作用机制也与DNA拓扑异构酶密切相关,因此它作为抗肿瘤药物的重要靶点引起了研究者的广泛关注。此外,科学家们还发现拓扑异构酶在神经发育调节上也起着一定的作用,虽然机制还需要进一步研究,但这一发现就有着重要意义。本文对DNA拓扑异构酶的反响、结构、分类及生物功能进行了简要的归纳,介绍了DNA拓扑异构酶抑制剂的研究及分类,并对拓扑异构酶在其他方面上的进展进行了简单的介绍。 关键词:DNA拓扑异构酶拓扑异构酶抑制剂抗肿瘤药物生物功能 DNA拓扑异构酶〔topoisomerase〕调控DNA超螺旋状态,它是存在于细胞核内的一类酶,参与DNA复制、重组、转录、修复等核内关键作用,它们能够催化DNA链的断裂和结合,从而影响DNA的拓扑状态。真核细胞的拓扑结构由两种关键拓扑异构酶拓扑异构酶I和拓扑异构酶II调节,拓扑异构酶I通过形成短暂的单链裂解-结合循环,催化DNA复制的拓扑异构状态的变化;相反,拓扑异构酶II通过引起瞬间双链酶桥的断裂,然后打通和再封闭,以改变DNA的拓扑状态。哺乳动物中,拓扑异构酶II又可以分为αII型和βII型。拓扑异构酶的应用也很广泛,如现这些酶是很多抗肿瘤药物的细胞内靶酶,在肿瘤细胞中,拓扑异构酶的含量高于正常细胞,所以以其为靶点的抑制具有一定特异性,因此对它的研究也越来越重视。 DNA拓扑异构酶I ω蛋白,大白鼠肝DNA拓扑异构酶I又称切刻-封闭酶(nicking-closingenzyme)。 DNA拓扑异构酶能催化的反响很多,如DNA拓扑异构酶I对单链DNA的亲和力要比双链高得多,这正是它识别负超螺旋DNA的分子根底,因为负超螺旋DNA常常会有一定程度的单链区。负超螺旋越高,DNA拓扑异构酶I作用越快。现道,生物体内负超螺旋稳定在5%左右,低了不行,高了也不行。生物体通过拓扑异构酶I和II的相反作用而使负超螺旋到达一个稳定状态。现已发现,编码E.coli拓扑异构酶I的基因topA发生突变,那么会引起旋转酶基因的代偿性突变;否那么,负超螺旋增高,细胞生活能力降低。拓扑异构酶I作用的碱基序列特异性不高,但切点一定在C的下游方向4个碱基(包括C本身)的位置。在将DNA单链切断后,拓扑异构酶I连接于切口的5端,并贮藏了水解磷酸二脂键的能量用以连接切口,因而拓扑异构酶I的作用不需能量供给。此外.拓扑异构酶I还能促进两个单链环的复性,其作用是解除复性过程所产生的链环数的负值压力,以使复性过程进行到底。如果在一个单链环上一个部位切断,而使另一部位绕过切口.那么可产生三叶形结构分子(trefoilknot)。如果有两个双链环,其中一个有一个切刻,拓扑异构酶I那么可以将切刻对面的一条链切断,使完整的双链环套进去,再连接起来而成为环连体分子(catenane)。 拓扑异构酶Ⅰ最早是1971年在大肠杆菌中被发现的,均为单体酶。拓扑异构酶Ⅰ根据其结构域功能可以划分为4个域:C端结构域(Cterminaldomain)、核心结构域(coredomain)、连接子区域(linkerdomain)和N端域(N-terminaldomain),其中C端结构域、核心结构域在催化活性中起主要作用。在拓扑异构酶Ⅰ的多个活性位点中,Arg488、Arg590、His632和Tyr723为研究比拟明确的4个活性位点[7,8]。除Tyr723位于羧基端结构域外,其余三个均位于拓扑异构酶Ⅰ的核心结构域,如下列图所示。 〔左a:TOPOⅠ晶体结构;右b:TOPOⅠ活性位点〕 DNA拓扑异构酶II 拓扑异构酶II能同时断裂并连接双股DNA链.它们通常需要能量辅因子ATP。在拓扑异构酶II中又可以分为两个亚类:一个亚类是DNA旋转酶(DNAgyrase),其主要功能为引入负超螺旋,在DNA复制中起十分重要的作用。迄今为止,只有在原核生物中才发现DNA旋转酶,另一个亚类是转变超螺旋DNA(包括正超螺旋和负超螺旋)成为没有超螺旋的松弛形式(relaxedform)。这一反响虽然是热力学上有利的方向,但不知道为什么它们仍然像DNA旋转酶一样需要ATP,这可能与恢复酶的构象有关。这一类酶在原核生物和真核生物中都有发现。 大肠杆菌的拓扑异构酶II除了引入负超螺旋以外.还具有形成或拆开双链DNA环连体和成结分子的能力。II类拓扑异构酶没有碱基序列特异性,它们可以和任何相交的两对双链DNA结合。DNA旋转酶有两个α亚基和两个β