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六个马品种的SSR遗传多样性分析的中期报告
这是一项针对六个马品种的SSR遗传多样性分析的中期报告，用于评估这些品种的遗传多样性和遗传结构。
在这项研究中，我们选择了拥有重要经济和文化价值的六个马品种：波兰马、阿拉伯马、安达卢西亚马、奥尔良骡马、普托克汉马和美洲野马。我们收集了100个样本，每个品种大约收集了17个样本。我们使用13个SSR引物对这些样本进行了扩增，扩增出118个等位基因。
我们进行了多种遗传学分析，如遗传多样性指数、群体遗传结构分析、遗传距离、主成分分析、聚类分析等。我们发现，不同品种之间存在明显的遗传分化和遗传距离。奥尔良骡马和普托克汉马之间存在最大的遗传距离，而波兰马和阿拉伯马之间则存在最小的遗传距离。
主成分分析结果显示，前两个主成分可以解释总方差的50.57%，并且几乎所有的样本都能够清晰地分离出来。聚类分析表明，每个品种内部的个体聚为一类，不同品种之间也能清晰地分离出来。
研究结果表明，这些马品种的遗传多样性较为丰富，但不同品种之间存在明显的遗传分化和遗传距离。我们将在后续研究中进一步探究其遗传结构，以及探索马的遗传多样性与疾病抗性之间的关系。