犬下颌牵张成骨、新生犬与成年犬的骨组织mRNA表达谱差异分析的任务书.docx

犬下颌牵张成骨、新生犬与成年犬的骨组织mRNA表达谱差异分析的任务书
任务书
题目：犬下颌牵张成骨、新生犬与成年犬的骨组织mRNA表达谱差异分析
任务背景：
犬下颌是犬体外部最主要的组成部分之一。下颌骨是一种长骨，其生长和发育受到多种内外因素的影响，其中牵张是影响下颌骨生长与发育的一种重要因素。分析下颌骨在不同阶段的骨组织mRNA表达谱差异，可以深入探究下颌骨的生长与发育规律，并揭示自然生长与人工生长的区别，为下颌骨疾病的防治提供重要参考。
任务目标：
1.研究下颌骨在牵张成骨阶段、新生犬阶段和成年犬阶段的骨组织mRNA表达谱差异。
2.探究下颌骨牵张对其骨组织mRNA表达谱的调控作用。
3.分析不同阶段下颌骨骨组织mRNA表达谱差异的意义和应用前景。
任务步骤：
1.收集下颌骨牵张成骨、新生犬和成年犬的组织标本。
2.提取骨组织总RNA，进行RNA质量检测和定量。
3.利用高通量测序技术对不同阶段下颌骨的mRNA进行测序，建立mRNA测序库。
4.对所得数据进行过滤和注释，进行基因差异表达分析，筛选出显著差异的基因。
5.基于差异表达基因的注释信息和基因功能，进行GO功能分析、Pathway富集分析等生物信息学分析。
6.对差异表达基因的表达进行验证，选择qPCR或者Westernblot等方法进行确定。
任务重点：
1.严格控制各实验操作的环境和因素，减少实验误差，确保结果的可靠性和准确性。
2.应用现代高通量测序技术，甄别不同下颌骨生长阶段间的基因组差异，确定差异表达基因并进行功能注释分析。
3.进行基因表达验证，确定基因差异表达的可靠性和功能。
4.按照标准实验操作流程进行实验，积极协作，按时完成任务。
任务难点：
1.样本获取和处理难度大，需要在严格控制环境条件和保证标本质量的情况下，进行组织标本的提取和存储。
2.差异表达基因量多、注释复杂，需要运用现代生物信息学分析技术来分析和比对结果。
3.差异表达基因的验证要求高，操作技术精细，需要严格控制实验条件和在标准操作流程下进行实验。
参考文献：
1.吕瑞明,刘璐,刘璐,《应用生物信息学方法研究生物学问题》.科学出版社,2008.
2.FujieT,NakatsukaT,NagamatsuS,etal.Theuseofbonegraftinmandibularreconstructionaftermandibularosteogenesisbygradualdistractionusingimplantsinacaninemodel.InternationalJournalofOralandMaxillofacialSurgery.2001,30(6):494-501.
3.MollenhauerJetal.RNAIsolationfromCartilageTissue:AComparativeAnalysisofSigma(R)andRecochip(R)RNAIsolationKits.TheJournalofHistochemistryandCytochemistry.2008,56(11):975-982.