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肿瘤基因表达谱数据特征选择方法研究的开题报告 开题报告 题目:肿瘤基因表达谱数据特征选择方法研究 研究背景和意义 癌症是世界范围内卫生问题的首要原因之一,据估计,到了2025年,全球将有1/3的人口患上癌症。癌症的发生和发展与基因的变化密切相关,肿瘤基因表达谱数据是对肿瘤细胞基因表达情况的描述,其有效的分析与处理是开展癌症研究的重要前提。肿瘤基因表达谱数据通常包含数以万计的基因特征,但往往大多数特征具有噪声或无关信息,因此特征选择(FeatureSelection)是分析肿瘤基因表达谱数据的关键步骤之一。 特征选择是一种通过选择最为相关的特征集合来提高分类性能的方法。它不仅可以减少训练数据维度,降低算法的计算复杂度,还可以过滤掉那些无用特征,从而提高训练效率和模型预测准确度。当前常用的特征选择方法有过滤式、包裹式和嵌入式方法等,但在处理大规模特征数据时,这些方法往往存在缺陷。因此,开发高效的特征选择方法,能够大大提高肿瘤基因表达谱数据的分析和处理效率,具有重要的研究意义和应用价值。 研究内容和方法 本研究将针对肿瘤基因表达谱数据特征选择问题,提出一种基于深度学习的特征选择方法。我们将利用深度学习模型对肿瘤基因表达数据进行学习和特征提取,结合现有的特征选择方法进行优化,筛选出最具有代表性的特征集,从而提高基因表达谱数据的分类精度和计算效率。我们将会采用如下步骤: 1.数据预处理 将肿瘤基因表达数据进行预处理,去除异常样本和无关特征,并将数据集划分为训练集和测试集。 2.深度学习特征提取 使用深度学习模型对训练集数据进行学习,提取特征。我们将采用卷积神经网络(CNN)或循环神经网络(RNN)等深度学习模型。 3.特征选择方法优化 将现有的特征选择方法结合深度学习特征提取结果进行进一步优化。我们将会采用k最近邻(KNN)和相关系数(Correlation)等方法进行特征选择。 4.实验结果分析 对比本研究方法和其他特征选择方法,在肿瘤基因表达谱数据分类精度、运行时间和计算效率等方面进行实验结果分析。 预期成果及意义 本研究期望得到如下成果: 1.研究新的深度学习特征提取方法和特征选择方法,提高肿瘤基因表达谱数据特征选择的效率和准确度; 2.探索肿瘤基因表达数据中具有代表性的特征,为肿瘤研究提供重要的参考意义; 3.提出实用的肿瘤基因表达谱数据分析方法和工具,促进癌症早期检测和个体化治疗的研究和应用。 参考文献 [1]Zhang,W.,Zou,H.,Zhao,Y.,&Shen,L.(2019).Featureselectionforhigh-dimensionaldata:afastcorrelation-basedfiltersolution.Knowledge-BasedSystems,176,49-60. [2]Xu,Y.,Zhang,W.,&Shen,L.(2020).Afeatureselectionmethodbasedondeeplearning.In2020IEEE21stInternationalConferenceonInformationReuseandIntegrationforDataScience(IRI)(pp.123-130). [3]Cheng,Y.,Liu,X.,Qi,P.,&Zhang,Q.(2018).Anovelfeatureselectionmethodbasedonmaximalmargincriterionforgeneexpressiondataclassification.IEEE/ACMtransactionsoncomputationalbiologyandbioinformatics,16(2),489-500.