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基于基因表达微阵列数据集的加权双向聚类算法研究的开题报告 开题报告 论文题目:基于基因表达微阵列数据集的加权双向聚类算法研究 一、研究背景和意义 随着高通量技术的飞速发展,微阵列技术已经成为目前最流行的分析基因表达的方法之一。这种技术可以同时检测数千个基因表达的情况,从而为基因表达谱、表观遗传和遗传遗传学的研究提供了重要的资料。微阵列的数据量是非常庞大的,同时也是非常复杂的,使用传统的聚类算法往往难以得到准确的分类结果。 基于此,本研究旨在通过一种新的聚类算法,即加权双向聚类算法,解决基因表达微阵列数据的分类问题。该算法使用权重信息来加强聚类算法的准确性和可靠性,并通过比较实现了更为精确的聚类。研究结果将为基因表达的分析和实际应用提供有力的支撑。 二、研究内容和研究方案 研究内容: 1.分析基因表达微阵列数据的基本原理和数据特征; 2.探索传统聚类算法的弊端和不足; 3.分析加权双向聚类算法的原理和特点; 4.设计加权双向聚类算法实验,针对基因表达微阵列数据进行分类测试,并分析测试结果; 5.归纳总结实验结果并提出改进方案,为基因表达数据的分类提供有力的支持。 研究方案: 1.收集基因表达微阵列数据集,并预处理、清洗数据,减少噪声干扰; 2.分析微阵列数据的特征,探索传统聚类算法的不足; 3.分析加权双向聚类算法的原理和特点,准备实验所需的数据集; 4.根据实验需求,设计加权双向聚类算法,通过编程实现并调试; 5.对加权双向聚类算法进行实验,得到分类结果,并对结果进行数据分析; 6.从实验结果中归纳总结加权双向聚类算法的优点和缺点; 7.提出改进方案,并对未来改进方法进行讨论。 三、研究的预期成果和意义 1.通过加权双向聚类算法的实验测试,得到更为准确的基因表达微阵列数据分类结果,并参考得到更多的结论; 2.针对传统聚类算法的不足,探索了新的解决方案,为基因表达数据的处理提供新的思路和方法; 3.为更好地分析和利用基因表达的数据提供了重要的依据和技术支撑,具有积极的意义和应用前景。 四、研究的工作计划及进度 时间节点工作程序完成情况 第1-2周研究基因表达微阵列数据的基本原理和特征完成 第3-4周探索传统聚类算法不足问题完成 第5周学习加权双向聚类算法完成 第6-7周准备实验所需的数据集完成 第8-9周设计加权双向聚类算法并编程实现完成 第10-12周加权双向聚类算法实验完成 第13-14周实验结果分析归纳总结完成 第15-16周研究改进方案并进行讨论完成 第17-18周重复实验和数据分析完成 第19-20周论文撰写与修改完成 五、参考文献 [1]ParikshitS.T.etal.Hybridclusteringofmicroarraydatawithvisualization[J].BMCBioinformatics,2008,9:1-16. [2]LiuW.etal.Acompactbiclusteringalgorithmforanalyzinggeneexpressiondata[J].PhysicaA:StatisticalMechanicsanditsApplications,2011,390(24):4540-4550. [3]HuX.G.etal.Researchonclusteringalgorithmofgeneexpressiondatabasedonanalysisofvariance[J].ChineseJournalofSensorsandActuators,2010,23(12):1870-1875.