甘蓝夜蛾核型多角体病毒基因组全序列分析的任务书.docx

甘蓝夜蛾核型多角体病毒基因组全序列分析的任务书
一、任务背景
甘蓝夜蛾（Plutellaxylostella）是卷叶蛾科昆虫中的一种小型昆虫，寿命短，繁殖力强，适应力强，生存能力极强，在各种环境下都能存活下来。甘蓝夜蛾是全球上最严重的甘蓝蔬菜害虫之一，对甘蓝蔬菜的危害极大，是蔬菜生产的主要质量问题之一。
甘蓝夜蛾核型多角体病毒（Plutellaxylostellagranulovirus，PxGV）是一种特殊的DNA病毒，目前已知在天然状态下专性感染甘蓝夜蛾幼虫，是甘蓝夜蛾捕食者的生物农药之一。研究PxGV的基因组结构和基因功能，对甘蓝夜蛾的防治具有重要的意义。
二、任务目的
本次任务的目的是通过对甘蓝夜蛾核型多角体病毒基因组全序列的分析，探索病毒基因与生物学特性之间的关系，深入研究PxGV的基因和蛋白质表达及其调控机制，为防治甘蓝夜蛾提供理论依据和技术支持。
三、任务要求和内容
（一）任务要求
1.对甘蓝夜蛾核型多角体病毒基因组进行全序列测序，获取完整的病毒基因组的序列信息。
2.对测得的PxGV基因组进行解析和注释，对其基本特点进行分析，包括基因数目、基因组结构和组成、启动子和转录方向等。
3.深入分析PxGV中非编码区域的结构特点和功能，研究病毒基因组的调控机制和与宿主互作的关系。
4.对PxGV的蛋白质进行鉴定和分析，研究其功能和调控机制。
机构要求
1.全面掌握分子生物学、生物信息学和基因工程等相关领域的基础理论和实验技术，具备较强的实验操作能力。
2.有较好的英文文献和期刊的阅读能力，熟悉生物数据库的使用。
二、任务进度
1.前期准备阶段：1个月。主要任务是收集和整理与PxGV相关的文献资料，熟悉所使用的实验设备和软件工具。
2.样品采集和DNA提取：1个月。根据实际情况选择合适的PxGV样品进行采集和DNA提取。
3.测序和序列分析：3个月。使用NGS测序平台对PxGV核型多角体病毒基因组进行测序，对测序结果进行分析，获取病毒基因组的完整序列信息。
4.基因、蛋白质分析和注释：3个月。对病毒基因组进行基因和蛋白质的鉴定、分析和注释，研究PxGV的基因和蛋白质的结构和功能。
5.病毒基因组注释结果分析和文献撰写：2个月。对分析结果进行总结和结论，并将研究成果发表在生物学相关期刊中。
三、预期结果和应用
预期结果：
1.获得甘蓝夜蛾核型多角体病毒基因组全序列，并对其进行生物学特性分析。
2.分析PxGV基因组结构、启动子以及转录方向等结构特点和功能。
3.研究PxGV中非编码区域的结构特点和功能，深入探究病毒基因组的调控机制。
4.对PxGV的蛋白质进行鉴定和分析，研究其功能和调控机制。
应用：
1.深入研究PxGV的基因和蛋白质表达及其调控机制，为甘蓝夜蛾的防治提供理论依据和技术支持。
2.为相关防治产品的研发和生产提供基础数据支持和技术服务。
3.为研究其他虫害的防治提供借鉴和参考。