拟南芥SHORT ROOT(SRT)基因的遗传分析及图位克隆的开题报告.docx

拟南芥SHORTROOT(SRT)基因的遗传分析及图位克隆的开题报告
一、研究背景
拟南芥是一种常见的模式植物，在遗传研究和基因组学领域都具有重要的应用价值。SHORTROOT（SRT）基因是拟南芥中一个重要的生长调控基因，其编码的蛋白质在根系的形成和发育过程中发挥关键作用。研究SRT基因的遗传分析和图位克隆是解析拟南芥根系发育机制的重要途径，对于理解拟南芥根系发育调控机制和提高作物产量具有重要的意义。
二、研究目的
本研究旨在通过遗传分析和图位克隆的方法，探索拟南芥SRT基因在根系发育过程中的调控机制。
三、研究内容
1.SRT基因遗传分析
采用遗传学方法，构建SRT基因的遗传连锁图谱，通过克隆已知标记和SRT基因的双亲杂交分析，确定SRT基因的遗传位置和遗传特性；同时，通过BAC库筛选和PCR扩增方法，克隆SRT基因片段进行序列分析，确定SRT基因在拟南芥基因组中的位置和分子特征。
2.SRT基因的图位克隆
通过基因克隆、扩增和筛选等方法，建立高密度连锁图谱，确定SRT基因的位置，并进一步实施克隆操作，从基因组中分离出SRT基因。基于SRT基因的序列信息和生物信息学分析方法，鉴定SRT基因的功能区域和转录启动子，研究其在拟南芥根系发育中的作用机制。
四、研究意义
1.揭示拟南芥SRT基因在根系发育过程中的作用机制，深化对植物发育调控的认识。
2.对拟南芥根系的发育调控机制进行研究，为作物发育调控和高产育种提供理论基础。
3.以SRT基因的克隆为基础，开展拟南芥根系的转录组学研究和分子筛选，用以发掘其他生长调控基因，在拟南芥发育调控机制研究方面打下基础。
五、研究难点
1.拟南芥遗传连锁图谱建立的精度和完整性较大，需要进行更加细致、全面的实验分析。
2.SRT基因的大小和复杂性较大，图位克隆和克隆操作的难度较大。
六、研究方法
1.PCR扩增
2.基因克隆
3.遗传分析
4.连锁图谱构建
7、预期成果
1.获得SRT基因的遗传连锁图谱和分子标记。
2.克隆SRT基因，获得其序列信息和生物学特性的分析结果。
3.揭示SRT基因在拟南芥根系发育中的功能和作用机制。
4.提高研究者在图位克隆和分子生物学领域方面的技术能力和研究水平。
八、进度安排
1.遗传分析和连锁图谱构建（第1-3个月）。
2.SRT基因克隆和分子特征分析（第4-6个月）。
3.SRT基因的功能分析（第7-10个月）。
4.结果分析和写作（第11-12个月）。
九、经费预算
1.实验费用：10000元
2.仪器费用：5000元
3.差旅费用：2000元
4.随机配套费用：3000元
5.人员费用：20000元
总计：40000元。