水稻根特异表达启动子的克隆及功能分析的任务书.docx

水稻根特异表达启动子的克隆及功能分析的任务书
任务书
任务名称：水稻根特异表达启动子的克隆及功能分析
任务目的：
1.克隆水稻根中特异表达的启动子序列，对其进行初步的分析和鉴定；
2.利用转基因技术，将该启动子与激素响应元件和报告基因结合，构建转基因水稻；
3.对转基因水稻进行基因表达分析，验证该启动子的转录调控功能；
4.探究该启动子在水稻生长发育过程中的作用机制。
任务背景：
水稻是我国主要粮食作物之一，对于水稻生长发育的研究一直是大家关注的焦点。现有的研究表明，水稻生长发育过程中，不同组织和器官中的基因表达存在巨大的差异，这种差异主要是由启动子的选择和调控机制所决定的。因此，研究水稻特异表达的启动子序列及其功能，对于深入了解水稻生长发育过程中的基因表达调控机制具有重要的意义。
任务内容：
1.根据已有文献或者数据库，筛选得到水稻根中特异表达的启动子序列，并进行基本的生物信息学分析；
2.利用PCR技术，从水稻根中提取基因组DNA，对该启动子进行特异性扩增；
3.将扩增的启动子序列进行亚克隆克隆，并进行测序和比对分析，验证扩增的序列的准确性和稳定性；
4.将该启动子序列与适当的激素响应元件和报告基因结合，构建转基因水稻；
5.对转基因水稻中该启动子的表达情况进行分析，确定其转录调控效应；
6.对转基因水稻进行生理生化指标的测定，探究该启动子在水稻生长发育过程中的作用机制。
任务计划：
1.第一周：收集相关文献及数据库，筛选得到潜在的水稻根特异表达的启动子序列；
2.第二周：对其中的启动子序列进行初步的生物信息学分析，包括启动子长度、启动子上游元件、启动子保守性等；
3.第三周：提取水稻根基因组DNA，利用PCR技术对筛选得到的启动子序列进行特异性扩增；
4.第四周：将扩增获得的启动子序列进行亚克隆克隆，并进行测序和比对分析；
5.第五周：将启动子序列与适当的激素响应元件和报告基因结合，构建转基因水稻；
6.第六周：对转基因水稻中该启动子的表达情况进行分析，确定其转录调控效应；
7.第七周：对转基因水稻进行生理生化指标的测定，探究该启动子在水稻生长发育过程中的作用机制；
8.第八周：整理实验数据，撰写实验报告。
任务要求：
1.可以选择不同的水稻品种作为实验材料；
2.实验过程中应注意实验室安全，严格按照实验指导书的要求进行操作；
3.实验结果应统计、整理，并进行图表展示；
4.实验报告内容应包含任务背景、任务目的、任务内容、实验结果、数据分析和结论等内容，长度不少于10页。
参考文献：
1.HeuerS,HansenK,RuppO,etal.Efficienteukaryoticpromoteranalysisusingflowcytometry.PlantJournal,2005,41(4):661-667.
2.YamamotoR,FujitaM,FujitaY,KawasakiS,etal.Expressionoffourmainstarchsynthesisgenesinseedlingsofrice.PlantScience,2007,172(4):642-648.
3.KarimiM,InzéD,DepickerA.GATEWAYvectorsforAgrobacterium-mediatedplanttransformation.TrendsinPlantScience,2002,7(5):193-195.