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冬小麦灌浆期高温胁迫差异表达基因的分离的任务书
任务名称：冬小麦灌浆期高温胁迫差异表达基因的分离
任务背景：随着全球气候变化，气温升高成为农作物生产面临的严峻挑战之一。冬小麦作为我国重要的农作物之一，也受到了高温胁迫的影响。高温胁迫会影响冬小麦生长发育和产量，因此研究冬小麦在高温胁迫下的生物学响应和适应机制是非常重要的。
任务要求：本任务旨在通过差异表达分析，分离出冬小麦灌浆期高温胁迫下的差异表达基因，并利用生物信息学手段对这些基因进行注释和分析。具体要求如下：
1.根据已有研究，确定冬小麦灌浆期的时间点及高温胁迫的处理方法。
2.采集高温胁迫处理和对照处理的冬小麦灌浆期样品，并提取RNA。
3.利用RNA-Seq技术对样品进行测序，并得到测序数据。
4.对测序数据进行质量控制、去除接头序列、去除低质量序列等预处理。
5.利用比对软件将清理后的测序数据比对到参考基因组（如小麦基因组）上，并得到比对文件（BAM格式）。
6.利用基因定量软件（如HTSeq）对比对文件进行基因定量，得到每个基因的表达量。
7.利用差异表达分析软件（如DESeq2）分析高温胁迫处理组和对照处理组的差异表达基因，并筛选出显著差异表达的基因。
8.对差异表达基因进行GO和KEGG通路分析等生物信息学分析，对差异表达基因的功能和代谢通路进行注释。
9.结合已有研究和分析结果，对冬小麦灌浆期高温胁迫的生物学响应和适应机制进行初步讨论。
10.撰写研究报告，包括实验设计、实验方法、结果分析和讨论等部分。
任务成果：
1.冬小麦灌浆期高温胁迫的差异表达基因列表。
2.差异表达基因分析结果和注释信息。
3.对讨论冬小麦高温胁迫的生物学响应和适应机制的报告。
任务周期：3-6个月。
参考文献：
1.谭建辉,白玉梅,彭洁,王杨,卢再胜.2018.冬小麦灌浆期高温胁迫下基因表达特征分析[J].中国农业科学,51(17):3271-3288.
2.陈慧葵,唐小玮,田世芹,尹瑞祥,张继瑞.2017.高温胁迫下小麦幼苗转录组差异分析[J].园艺学报,44(12):2257-2268.