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皮肤鳞癌致癌作用的TGF-β1/miRNA/靶基因轴筛选及表征的任务书
任务书
任务名称：皮肤鳞癌致癌作用的TGF-β1/miRNA/靶基因轴筛选及表征
任务背景：
皮肤鳞癌是一种常见的皮肤恶性肿瘤，常见于皮肤部位，如面部和头皮，使皮肤处于慢性紫外线暴露的人流中风险增加。不断的细胞分裂和增殖导致一些基因的突变，最终导致皮肤鳞癌的发生。近年来的研究表明，TGF-β1/miRNA/靶基因轴参与了皮肤鳞癌的发生和发展。因此，本任务旨在筛选和表征这一轴及其在皮肤鳞癌中的作用。
任务描述：
1.文献搜寻：通过检索相关数据库和文献，搜寻TGF-β1/miRNA/靶基因轴相关的研究，获取相关信息。
2.筛选靶基因：根据已有文献，筛选出与TGF-β1/miRNA/靶基因轴相关的潜在靶基因。
3.表征靶基因：使用相关软件进行基因表达谱和生物信息学分析，对靶基因进行表征，包括其在皮肤鳞癌中的表达情况、预测的功能和相关的调控因素。
4.筛选miRNA：根据已有文献和前期表征结果，筛选出与TGF-β1/miRNA/靶基因轴相关的潜在miRNA。
5.验证相关性：通过实验验证皮肤鳞癌组织和正常皮肤组织中miRNA和靶基因的表达差异，并测定它们之间的相互关系。
6.对路径进行整合：结合前期的结果，建立TGF-β1/miRNA/靶基因轴的信号通路，并进一步探究其在皮肤鳞癌的发生和发展中的作用机制。
任务成果：
1.筛选出TGF-β1/miRNA/靶基因轴中与皮肤鳞癌相关的靶基因和miRNA。
2.对筛选出的靶基因和miRNA进行表征，确定其在皮肤鳞癌中的作用机制。
3.通过实验验证，确定TGF-β1/miRNA/靶基因轴中miRNA和靶基因的表达差异，并探究它们之间的相互关系。
4.建立TGF-β1/miRNA/靶基因轴的信号通路，并阐述其在皮肤鳞癌发生和发展中的作用机制。
任务要求：
1.团队成员具有生物学或相关领域的知识背景，熟悉相关的数据库和分析软件，如NCBI、Ensemble、R、Python等。
2.任务完成时间为2个月。
3.团队成员需每周提交任务进度报告，及时反馈问题和讨论解决方案。
4.团队成员需撰写任务报告，包括任务的研究背景、方法流程、结果和讨论。
任务参考文献：
1.KimYS,KwonSH,JungHS,etal.TGF-β1-induciblemiR-503controlscellproliferationandcorrelateswithpoorprognosisofrenalcellcarcinoma.KoreanJPathol.2013;47(2):113-119.
2.MaC,ZhangK,XuT,etal.MiR-9-5ppromotesMSCmigrationbyactivatingβ-cateninsignalingpathway.PLoSOne.2013;8(9):e73486.
3.NarayananBA,NarayananNK,DesaiKV,etal.PAX2isdifferentiallyexpressedinvarioustypesofhumancanceranditselevatedexpressioninbladdercanceriscorrelatedwithoverexpressionofEYA1.Oncogene.2006;25(53):7239-7248.