刺参遗传多样性的微卫星及RAPD分析的任务书.docx

刺参遗传多样性的微卫星及RAPD分析的任务书
任务名称：刺参遗传多样性的微卫星及RAPD分析
任务背景：
刺参（Apostichopusjaponicus）是重要的经济水产品。为了维持刺参的生态平衡和促进其发展利用，需要深入了解刺参的遗传多样性。本任务旨在利用微卫星和RAPD技术研究刺参的遗传多样性。
任务要求：
1.收集刺参样本，共计200个。按照地理位置分为5组，每组40个。其中每个个体来自不同产地。
2.提取样本的基因组DNA，采用CTAB法或商用基因组DNA提取试剂盒。
3.设计和筛选20对刺参微卫星引物，并利用PCR扩增上述200个样本的微卫星序列。
4.对扩增产物进行毛细管电泳，获取微卫星图谱并测定微卫星长度。
5.统计并分析微卫星基因多样性指标，包括观测杂合度、期望杂合度、全基因型多样性等，并构建遗传关系树。
6.选择15条RAPD引物，并用PCR扩增100个样本的DNA序列。
7.对扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，获取RAPD图谱。
8.统计并分析RAPD基因多样性指标，包括多态性信息含量、分子方差等，并构建遗传关系树。
9.撰写实验报告，总结刺参的遗传多样性分析结果并提出建议。
任务时间：2个月。
任务预算：20,000元。