扁蓿豆和青藏扁蓿豆居群遗传结构、MrLEA3基因适应性进化分析的任务书.docx

扁蓿豆和青藏扁蓿豆居群遗传结构、MrLEA3基因适应性进化分析的任务书
任务书：
背景介绍：
扁豆属（VignasubgenusCeratotropis）是豆科植物中一类重要的食用豆类，其分类学地位一直饱受争议。扁蓿豆是扁豆属最为广泛分布的物种之一，可分为扁蓿豆（V.angularis）和青藏扁蓿豆（V.cylindrica）。扁蓿豆是中国南方重要的农作物之一，而青藏扁蓿豆则生长在中国西南高原的荒漠生态系统中，拥有耐旱、耐寒等逆境适应性。
任务目的：
本任务旨在探究扁蓿豆和青藏扁蓿豆居群遗传结构以及MrLEA3基因的适应性进化，为扁豆属植物的分类学和自然适应性研究提供有价值的参考。
任务分析：
1.收集样本：本任务需要收集扁蓿豆和青藏扁蓿豆的样本，要求样本来源地点分布在两物种分布范围内的不同交错地带，以保证样本的多样性和代表性。
2.分离DNA：采用基础性的DNA分离方法，提取样本中的总DNA。
3.大规模测序：利用现代高通量测序技术，对样本中的DNA进行全基因组或限制性片段长度多态性等测序，得到高质量基因组数据。
4.居群遗传分析：基于大规模测序数据，采用计算机软件对扁蓿豆和青藏扁蓿豆的居群遗传结构进行分析，进一步揭示两物种的归属关系和基本遗传特征。
5.MrLEA3基因分析：根据测序数据鉴定MrLEA3基因在两物种中的存在，并进行生物信息学分析，探究该基因是否参与到生长繁殖等功能中，并在两个物种中可能进行适应性选择的演化过程。
6.结果分析：对数据进行统计分析，绘制适当的数据图表，对居群遗传结构和MrLEA3基因的功能进化进行综合分析，提出合理的解释和结论。
任务成果：
1.居群遗传结构分析结果；
2.MrLEA3基因的生物信息学特征；
3.两物种MrLEA3基因的遗传变异与适应性进化演化关系；
4.图表统计和成果解释与结论。
任务时间安排：
1.项目立项时间：2021年7月1日
2.样本收集和DNA分离：2021年7月1日-2021年9月30日
3.大规模测序：2021年10月1日-2022年1月31日
4.居群遗传分析和MrLEA3基因分析：2022年2月1日-2022年4月30日
5.结果整理、分析和报告撰写：2022年5月1日-2022年7月31日
6.结题验收和论文发表：2022年8月1日-2022年10月31日
任务经费预算：
1.样本收集和处理：5000元；
2.大规模测序：12000元；
3.计算机统计软件购买和使用费用：8000元；
4.结果整理和报告撰写：6000元；
5.其他差旅和日常开销：2000元。
总经费预算：33000元。