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银杏种子休眠不同阶段的转录调控研究的开题报告
开题报告：银杏种子休眠不同阶段的转录调控研究
摘要：
银杏是中国传统药材，银杏种子因其具有一定的药用价值，在世界广泛栽培种植。但是，银杏种子的发芽率比较低，困扰着银杏的种植和生产。种子休眠是银杏种子发芽率低的主要原因之一，因此深入研究银杏种子的休眠机制及其控制因素具有重要意义。本研究旨在探究银杏种子休眠不同阶段的转录调控机制，为银杏种子发芽率提高和银杏产业的发展提供新的思路和方法。
关键词：银杏种子；休眠；转录调控机制
一、研究背景
银杏是世界上最原始的种子植物之一，适应性广泛，耐旱、耐寒、耐酸碱等特点，是一种具有很高经济价值和观赏价值的树种。银杏种子具有药用、食用等多种用途，同时也是银杏繁殖的最主要方式。但是，银杏种子发芽率低是影响银杏种植和生产的主要问题之一。研究表明，银杏种子的高度休眠是导致其发芽率低的主要原因之一。银杏种子的休眠除了取决于外界环境因素，还与内源性因素的调控密切相关。目前，关于银杏种子休眠的研究相对较少，对于银杏种子休眠的机制及调控因素还存在一定的不了解，因此有必要进一步深入探究其相关机制。
二、研究目的和意义
为深入探究银杏种子休眠机制和发芽调控过程中的生物学特征，本研究将针对银杏种子不同阶段进行转录调控的分析，对银杏种子休眠机制的相关调控因素进行研究，探究银杏种子内源性调控和外部环境因素的相互作用，从而为解决银杏种子发芽率低的问题提供新的思路和方法。
三、研究内容和方法
1.样品来源：银杏种子
2.实验设计
选取经过种皮剥离后的银杏种子，按照发芽率高低，分为休眠期、去休眠期、萌发期3个不同阶段。
3.样品处理
将不同阶段的银杏种子进行RNA的提取，并利用测序技术对其进行转录组的分析，确认不同期间的转录差异，并筛选出关键转录因子。
4.生物信息学数据分析
借助GO（GeneOntology）注释、KEGG（KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes）通路分析、WGCNA（WeightedGeneCo-expressionNetworkAnalysis）等技术，深入分析不同阶段所筛选出的差异基因的生物学意义及其相关通路。
附录：章节概述
第一章：引言
银杏种子休眠机制研究的背景和意义。
第二章：文献综述
银杏种子休眠和发芽的相关研究现状及问题。
第三章：材料与方法
试验设计、生物信息学数据分析等方法的详细描述。
第四章：实验与结果
对样品的RNA提取、测序分析及结果的生物学注释和数据分析。
第五章：讨论
对实验结果进行分析和总结。
第六章：结论
本研究的主要结论和推广展望。
参考文献
[1]何启维.银杏现代应用[M].上海:上海科学技术出版社,2003:15-20.
[2]李红,陈妍,杨勐,等.银杏种子去休眠相关基因的基因组规模分析[J].园艺学报,2017,44(10):1985-1994.
[3]刘学瑞,王文瑞.银杏种子休眠研究进展[J].林业科技,2014,(4):29-31.