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基于网络拓扑特性的关键蛋白质识别算法的研究的任务书
一、研究背景
在生物学领域中，蛋白质是细胞功能和结构的重要组成部分，它们在生物体内发挥着非常关键的作用。因此，筛选出蛋白质中的关键蛋白质，对于理解生物体内的生命现象和解决疾病问题具有非常重要的作用。而在蛋白质筛选的过程中，如果能够利用网络拓扑特性进行分析，就能够大大提高筛选的效率和准确性。
二、研究目的
通过对网络拓扑特性进行分析，研究关键蛋白质的特点和所在位置，探究其与其他蛋白质之间的关系，以期提高关键蛋白质的筛选效率和准确性，为生物学研究提供有力的支持。
三、研究内容
1.网络拓扑特性分析算法的研究。
2.关键蛋白质筛选算法的研究。
3.蛋白质网络构建算法的研究。
4.蛋白质网络数据挖掘算法的研究。
5.关键蛋白质在网络中的地位和特点的研究。
6.算法的实现与测试。
四、研究方法
1.收集相关文献，了解当前关键蛋白质的筛选方法和网络拓扑特性研究现状。
2.开展网络拓扑特性的分析，并利用相关算法进行分析。
3.利用现有数据构建蛋白质网络，并进行数据挖掘和分析。
4.利用机器学习算法进行关键蛋白质的筛选和分析，并对算法进行优化。
5.基于实验数据对算法的可行性和准确性进行测试和验证。
五、研究意义
1.提高关键蛋白质的筛选效率和准确性。
2.构建蛋白质网络，推进生物网络研究。
3.为解决疾病问题提供理论依据。
4.为药物开发提供支持和参考。
六、进度安排
1.文献综述（1个月）。
2.网络拓扑特性分析和筛选算法的设计（2个月）。
3.蛋白质网络构建和数据挖掘算法的研究和实现（2个月）。
4.关键蛋白质的筛选和分析算法的研究（2个月）。
5.实验和数据分析（1个月）。
6.论文撰写和完成（1个月）。
七、预期成果
1.一种基于网络拓扑特性的关键蛋白质筛选算法。
2.一种蛋白质网络构建算法。
3.关键蛋白质在网络中的地位和特点的分析结果。
4.相关算法的实现代码和测试结果。
5.发表1篇SCI论文。
八、经费预算
1.硬件设备费：2000元。
2.文献及实验分析费：5000元。
3.差旅和会议费：3000元。
4.工作人员及实验费用：10000元。
总计：20,000元。
九、参考文献
1.Ezawa,K.&Yoshida,R.(2006).Anefficientalgorithmfortheidentificationofessentialproteinsbynetworkanalysis.JournalofComputationalBiology,13(2):141-152.
2.Li,Y.&Tang,Z.(2011).Network-basedanalysisofproteininteractionsfortheprioritizationofdrugtargets.MolecularBioSystems,7(7):2164-2172.
3.Wei,B.Q.,Chen,L.&Ru,B.(2012).Network-basedpredictionofproteininteractions.MolecularBioSystems,8(5):1542-1551.
4.张华蕾,李宏.基于网络拓扑特性的蛋白质关键性分析算法研究现状[J].华中科技大学学报(自然科学版),2017,03:44-50.