基于基因芯片的母猪妊娠相关基因调控网络构建的中期报告.docx
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基于基因芯片的母猪妊娠相关基因调控网络构建的中期报告本研究基于基因芯片技术,针对母猪妊娠过程中的基因调控网络进行了初步构建和分析。具体来说,我们首先收集了妊娠期间四个时间点(分别为天20、30、50和70)的子宫组织样本,并分别进行了基因芯片分析。然后,通过对比差异表达基因(DEGs)的筛选和功能注释,以及共表达关系的挖掘,我们初步建立了一个包含285个调控基因和650个转录因子的妊娠相关基因调控网路。接下来,我们进一步分析了该调控网络中的关键模块和GO/KEGG生物信息学差异富集,发现这些基因主要参与了
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基因调控网络的构建算法研究的中期报告基因调控网络是由基因之间的相互作用和调节构成的复杂系统,控制着基因的表达和生物体的生长发育等生命活动。为了深入研究生物系统的功能和调节机制,重建基因调控网络是一个重要的研究方向。本研究的研究目的是基于转录因子-基因关系来构建基因调控网络,并且探索新的构建算法以提高网络的准确性和可靠性。这里概述了本研究的中期报告。1.数据集准备我们使用的是来自人类基因组采集计划(HumanGenomeProject)和ENCODE项目的转录因子结合数据和基因表达数据。这些数据是从人体组织
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基于贝叶斯网络构建的基因表达调控网络分析的中期报告一、研究背景基因表达调控网络指的是定义基因组中所有基因与其他基因及其它控制基因表达的分子之间相互作用的网络模型。贝叶斯网络是目前应用较为广泛的用于处理不确定性事物的概率图模型,因其不需要准确定义模型参数而被广泛应用于基因调控网络的建模。二、研究内容本研究旨在构建一个基于贝叶斯网络的基因表达调控网络模型,针对性地分析该模型在基因调控网络分析中的应用,用于解释生物学现象和预测基因表达的变化。目前,已经通过使用高通量测序技术获得了大量的基因表达数据。然而,在生物
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基于多源数据融合的变结构DBN模型基因调控网络构建的中期报告本研究旨在通过利用多源数据融合的方法,构建基于变结构深度信念网络(DBN)的基因调控网络模型,以更好地理解基因调控机制。目前已完成以下工作:1.数据收集和预处理:从公共数据库中收集了人类胃癌组织和正常组织的基因表达数据和ChIP-seq数据,进行了挑选和预处理,以去除异常数据和缺失值,并对基因进行了注释。2.特征选择:采用了多种策略对数据集进行特征选择,包括相关性分析、方差分析和特征重要性评估等,以减少特征数量并提高模型的准确性。3.DBNN模型