MeJA诱导人参细胞皂苷生物合成的比较转录组分析的任务书.docx

MeJA诱导人参细胞皂苷生物合成的比较转录组分析的任务书
任务背景：
人参是一种重要的药用植物，其具有多种药理活性，如抗肿瘤、抗疲劳、免疫调节等。人参中的细胞皂苷是人参药效的主要成分之一，而MeJA是诱导植物细胞对压力和外界刺激的一种重要信号分子，能够增加植物内源激素信号，促进细胞皂苷生物合成。因此，研究MeJA对人参细胞皂苷生物合成的调控机制，可以为提高人参中细胞皂苷含量及提高人参品质提供理论依据。
任务描述：
本次任务旨在进行MeJA诱导下人参细胞皂苷产生的转录组分析。主要包括以下任务：
1.测定MeJA处理和对照组人参细胞皂苷含量的变化，并进行比较统计分析。
2.对MeJA处理和对照组进行RNA测序，获取转录组序列数据，并进行质量控制和过滤。
3.对测序数据进行比对，生成基因表达量矩阵。
4.进行差异表达分析，筛选出差异表达基因，并进行功能富集分析。
5.对筛选出的差异表达基因进行KEGG通路富集分析，筛选与细胞皂苷生物合成相关的信号通路。
6.对筛选出的基因进行RT-qPCR验证，验证基因差异表达结果的准确性。
任务成果：
1.MeJA处理和对照组人参细胞皂苷含量变化曲线和比较统计分析结果。
2.RNA测序的原始数据和质量控制、过滤等处理结果。
3.基因表达量矩阵和差异表达基因列表。
4.差异表达基因的功能富集分析结果和KEGG通路富集分析结果。
5.RT-qPCR验证结果。
任务计划：
本次任务预计需要6个月时间完成，任务计划如下：
月份任务内容
第1-2个月实验组织细胞培养，MeJA处理和对照组制备，细胞皂苷含量测定。
第3-4个月RNA提取、RNA测序和数据质控、过滤等处理。
第5-6个月序列比对、基因表达量矩阵生成、差异表达基因筛选、功能富集分析和KEGG通路富集分析、RT-qPCR验证。
任务要求：
1.具有分子生物学、生物信息学等相关学科的理论基础知识。
2.具有植物细胞培养、RNA提取、RT-qPCR等实验技能。
3.具有RNA测序和生物信息学分析经验。
4.能够熟练使用生物信息学常用软件和数据库。
5.具有较好的数据分析和解释能力。
6.具有良好的团队合作精神和责任心。