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基于支持向量机的蛋白质相互作用位点的预测的任务书 任务目标: 本任务旨在基于支持向量机算法构建蛋白质相互作用位点预测模型,对给定的蛋白质序列进行预测,并评估模型的预测性能。 任务内容: 1.收集相关文献,熟悉支持向量机算法和蛋白质相互作用位点预测的基本方法。 2.收集蛋白质相互作用位点预测的数据集,并进行数据预处理。 3.构建支持向量机模型,考虑各种参数的选择,使用交叉验证的方法对模型进行优化。 4.对测试集数据进行预测,并计算准确率、敏感度、特异度等模型评价指标。 5.对模型进行误差分析,分析模型的优缺点,并提出改进措施。 任务要求: 1.确保代码的可读性、可运行性和可扩展性。 2.提供详细的任务报告,说明任务的目的、内容、方法和结果,包括所用算法的原理、优缺点及应用范围等。 3.在任务报告中,对实验结果进行评价分析,并提出进一步研究的建议。 4.任务完成后,需提交可运行的代码和相关文献。 参考文献: 1.Zeng,X.,Zhang,X.,Zou,Q.Anintegrativeapproachforpredictingprotein-ligandbindingsiteswithRBFkernelandrandomforest.MolBiosyst.2016;12:2498-507. 2.Li,ZR.,Lin,HH.Thepotentialofsupportvectormachineinvirtualscreeningforthebindingaffinityofprotein-ligandcomplex.JComputChem.2006;27:482-91. 3.Fan,H.,Zhang,J.,Chen,JZ.,Zheng,CH.,Ji,ZL.SVM-basedpredictionofprotein-ligandbindingsitesusingascoringfunctionwithanewclusteringstrategy.CurrProteinPeptSci.2011;12:294-306.