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荧光定量PCR检测肝癌相关基因表达并建立分子诊断指数的开题报告
一、研究背景及意义
肝癌是一种高发疾病，为全球第五位最常见的癌症。据全球肝癌监测组织（GLOBOCAN）公布的数据，2018年全球肝癌新发病例约有841,080例，其中亚洲地区是肝癌高发区域之一。肝癌的发病机制是非常复杂的，目前尚不十分明确，但与遗传、生物学、环境和生活方式等因素有关。因此，寻找合适的治疗方法非常重要，而分子诊断技术可以为肝癌的早期预防和治疗提供帮助。
一种常见的分子诊断技术是荧光定量PCR（qPCR），它可以快速、敏感地检测特定基因的表达情况。然而，目前尚缺乏适用于肝癌的多基因分子指数。
因此，本研究旨在通过qPCR技术检测肝癌相关基因的表达，并建立一种分子诊断指数，以帮助肝癌的早期诊断和治疗。
二、研究内容和方法
1.研究内容
（1）提取肝癌和正常组织的RNA，并经过质量检测。
（2）借助qPCR方法测定肝癌和正常组织中相关基因的表达水平。
（3）借助bioinformatics工具，筛选与肝癌相关的基因，包括转录因子、信号通路关键分子，如TGF-β、CTGF、VEGF等。
（4）根据表达水平和细胞功能信息，筛选有代表性的基因作为分子指数的依据。
（5）建立分子诊断指数，并对样本进行分类区分。
2.研究方法
（1）采集肝癌和正常肝组织样本。
（2）利用蛋白酶K进行细胞情况预处理，分离RNA。
（3）qPCR实验检测肝癌和正常肝组织中相关基因的表达水平。
（4）根据实验结果及文献研究，选择有代表性的基因进行分子指数的建立。
（5）利用bioinformatics工具对基因进行分析和处理。
三、研究预期结果
本研究应能得到以下预期结果：
（1）确定与肝癌相关的基因。
（2）筛选出分子指数所需的代表性基因。
（3）建立一种基于qPCR技术的分子诊断指数并进行初步验证。
（4）比较该分子指数与现有诊断方法的敏感性和特异性。
四、研究进度及计划
1.研究进度
本研究的进度计划如下：
（1）采集肝癌和正常肝组织样本，分离RNA。（已完成）
（2）实验检测肝癌和正常肝组织中相关基因的表达水平。（已完成）
（3）选择有代表性的基因进行分子指数的建立。（进行中）
（4）利用bioinformatics工具对基因进行分析和处理。（进行中）
（5）建立基于qPCR技术的分子诊断指数并进行初步验证。（计划中）
2.研究计划
本研究的计划如下：
时间节点任务
2021年8月-9月采集肝癌和正常肝组织样本，分离RNA
2021年9月-10月qPCR实验检测肝癌和正常肝组织中相关基因的表达水平
2021年10月-11月选择有代表性的基因进行分子指数的建立
2021年11月-12月利用bioinformatics工具对基因进行分析和处理
2022年1月-3月建立基于qPCR技术的分子诊断指数并进行初步验证