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水稻品种内生细菌及其根系微生物群落多样性的研究 绪论 1.1水稻内生菌的研究进展 植物内生菌的定义 水稻中的内生细菌 水稻内生细菌的起源 水稻内生细菌的多样性 水稻内生细菌的功能 1.2植物内生细菌和根系微生物与植物的相互关系 1.2.1植物内生细菌和根系微生物对寄主的促生作用 1.2.2.植物内生细菌与根系微生物对寄主植物病原微生物的拮抗作用 1.2.3植物内生细菌与根系微生物的代谢产物对植株生长的影响 1.3微生物群落结构研究方法 1.3.1微生物群落结构传统研究方法 1.3.2以磷脂脂肪酸(PLFA)为代表的生物标记法 补充一个:脂肪酸鉴定微生物的准确性,,,,,,作为生态学研究给出一个指纹图谱,,, 1.4本研究的总体思路、主要内容及创新点 1.4.1总体思路 1.4.2主要内容 1.4.3创新点 第二章水稻品种内生细菌群落结构的多样性 2.1材料与方法 2.1.1水稻品种的采集 2.1.2内生细菌的分离与培养 2.1.3内生细菌种类鉴定 2.1.3.1培养基及脂肪酸提取试剂 2.1.3.2脂肪酸的提取 2.1.3.3脂肪酸的检测 2.1.4数理统计方法 2.2结果与分析 2.2.2水稻内生细菌种类鉴定 2.2.1水稻内生细菌群落结构分析 2.2.4水稻不同部位内生细菌群落聚类分析 2.2.3水稻内生细菌群落主成分分析 第三章水稻品种内生细菌与根系细菌的相关性 3.1材料与方法 3.1.1水稻品种 3.1.2水稻内生细菌和根系微生物的分离与培养 3.1.3水稻内生细菌与根系微生物种类鉴定 3.1.4水稻品种内生细菌与根系细菌的相关性分析 3.2结果与分析 3.2.1水稻内生细菌和根系微生物种类鉴定 3.2.2水稻内生细菌与根系微生物群落结构多样性指数比较 3.2.3水稻内生细菌与根系微生物群落结构典型相关分析 第四章水稻内生菌群落脂肪酸生物标记的多样性 4.1材料与方法 4.1.1水稻材料 4.1.2总体脂肪酸提取 4.1.2.1脂肪酸提取试剂 4.1.2.2脂肪酸提取步骤 4.1.2.3脂肪酸的检测 4.1.3数理统计方法 4.2结果与分析 4.2.1水稻植株脂肪酸生物标记分析结果 4.2.2水稻内生菌群落脂肪酸生物标记的多样性 4.2.3水稻品种内生菌群落脂肪酸生物标记的多样性指数 第五章水稻根系微生物群落脂肪酸生物标记的多样性 5.1材料与方法 5.1.1水稻根系土的采集 5.1.2水稻根系微生物总体脂肪酸的提取 5.1.3水稻生物学特性调查 5.1.4数据统计方法 5.2结果与分析 5.2.1水稻根系微生物脂肪酸生物标记的群落结构分析 5.2.2水稻根系微生物脂肪酸生物标记的多态性聚类分析 5.2.3水稻品种根系微生物特征脂肪酸生物标记的分析 5.2.4水稻品种根系微生物脂肪酸生物标记总量的聚类分析 5.2.5水稻根系微生物脂肪酸生物标记与水稻生物学特性的相关性分析