近海细菌hzo基因及古菌amoA基因多样性研究-环境工程毕业论文.doc

中国石油大学（华东）本科毕业设计（论文）

中国石油大学（华东）毕业设计（论文）

近海细菌hzo基因及古菌amoA基因
多样性研究

学生姓名：
学号：
专业班级：环境工程2005-1班
指导教师：

2009年6月16日
中国石油大学（华东）本科毕业设计（论文）
摘要

胶州湾和海南岛海域优美的自然环境与独特的地质演化进程吸引了众多中外科学家的关注。这种复杂的地质演化过程必然也伴随着生物的不断进化。
本实验中涉及的hzo和amoA基因序列可用于物种多样性的分析，相对于比较DNA所有序列，更简便并具有代表性。本实验通过对胶州湾A5站位微生物hzo基因以及海南岛海域E505站位amoA基因的PCR扩增，转入感受态大肠杆菌，酶切分析，测序比功能比对等一系列步骤，分别建立这两站位的微生物系统树。
本实验所采集的样品来自于胶州湾和海南岛海域，实验采用对沉积物进行hzo和amoA基因文库构建进一步测序分析进化关系的方法。通过建立的系统发育树可以对两个站位的微生物多样性进行评估。本次实验证明胶州湾A5站位hzo基因多样性较少而海南岛海域E505站位amoA基因有较高多样性。

关键词：厌氧氨氧化；hzo基因；amoA基因

abstract

ThebeautifulnaturalsceneriesandtheuniqueprocessofgeologicalevolutionofJiaozhouBayandHainanIslandwatersareattractingmoreandmoreChineseandforeignscientists.Thecomplexgeologicalevolutionmaygowithcontinuousevolutionoflivingbeings.
Thisstudyanalyzedthearchaealandbacterialdiversitybytheconstructionofgenesequencesthatcanbeappliedtotheanalysisofspeciesdiversity.Inthisexperiment,sedimentDNAfromJiaozhouBayandHainanIslandcoastalareaswasextracted;hzogenesandamoAgeneswereamplifiedthroughPCRwithdegenerateprimersjustifiedbyformerresearches,insertedintoplasmids,whichwerethentransformedwithcompetentE.colicells,analyzedbyRFLP,andsequenced.Afterseriesofprocedures,phylogenetictreesbasedonhzoandamoAgeneswereconstructed,whichisagoodindicationofmicrobediversity.
ThesedimentsamplesusedinthisstudywerecollectedfromtheJiaozhouBayandHainanIslandWaters.ThisstudyanalyzedthearchaealandbacterialdiversitybytheconstructionofhzoandamoAgenelibraries.Fromthetwophylogenetictreesconducted,wecanseehzogenesofstaionA5ofJiaozhouBayhaslowdiversitywhileamoAgenesofstationE505ofHainanIslandhashighdiversity.

Keywords:Anammox;hzogenes;amoAgenes目录

TOC\o"1-3"\h\z\uHYPERLINK\l"_Toc232922094"第1章前言 PAGEREF_Toc232922094\h1
HYPERLINK\l"_Toc232922095"1.1胶州湾生态环境 PAGEREF_Toc232922095\h1
HYPERLINK\l"_Toc232922096"1.2厌氧氨氧化细菌 PAGEREF_Toc232922096\h1
HYPERLINK\l"_Toc232922097"1.3该实验涉及的的分子生物学技术 PAGEREF_Toc232922097\h3
HYPERLINK\l"_Toc232922098"1.3.1PCR技术 PAGEREF_Toc23292