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主要内容核酸(nucleicacid)是遗传信息的携带者,是基因表达的物质基础。 无论是进行核酸结构还是功能研究,首先需要对核酸进行分离和纯化。 核酸样品质量将直接关系到实验的成败。1核酸分离、纯化原则1.2防止核酸的生物降解1.2.1DNA酶抑制剂1.2.2RNA酶(RNAase)抑制剂(2)DEPC(二乙基焦碳酸盐)(C2H5OCOOCOOC2H5) 粘性液体,很强的核酸酶抑制剂。 作用机制:与蛋白质中His结合使蛋白变性。 使用注意: 1)DEPC也能破坏单链核酸中大部分腺嘌呤环。但浓度比使蛋白质变性的浓度大100~1000倍。 2)容易降解,保存在4℃或液氮中; 3)提RNA时,0.1%DEPC浸泡器皿37℃2h。 4)剧毒。(3)肝素 (4)复合硅酸盐(Macaloid) (5)RNase阻抑蛋白(RNasin) (6)氧钒核糖核苷复合物(Vanadyl-RibonucleosideComplex,VRC)(1)高速组织捣碎机捣碎 (2)玻璃匀浆器匀浆 (3)超声波处理法 (4)液氮研磨法 (5)化学处理法(SDS、LDS,吐温80等) (6)生化法(溶菌酶、纤维素酶等)2.2核蛋白的解聚、变性蛋白的去除 核酸与蛋白质的结合力主要是正负静电吸力(核酸与碱性蛋白的结合)、氢键和非极性的范德华力。 分离核酸最困难的是将与核酸紧密结合的蛋白质分开,同时避免核酸降解。2.2.1加入浓盐溶液(如NaCl) 核酸-蛋白质加入NaCl后,破坏静电吸力,使氢键破坏,核蛋白解聚; 2.2.2加入SDS SDS除有破胞和抑制核酸酶的作用外,还具有使核酸从蛋白质上游离出来的功能;2.2.3酚/氯仿抽提 酚/氯仿混合使用能增加去除蛋白的效果,并对核酸酶有抑制作用。 氯仿比重大,能加速有机相与水相分层,减少残留在水相中的酚,同时氯仿具有去除植物色素和蔗糖的作用。 在酚/氯仿抽提核酸提取液时,需要振摇,为防止起泡和促使水相与有机相的分离,再加上一定量的异戊醇(酚:氯:异戊醉=25:24:1)。(1)使用注意 酚通常是透明无色的结晶,如果酚结晶呈现粉红色或黄色,表明其中含有酚的氧化产物,例如醌、二酸等。变色的酚不能用于核酸抽提实验,因为氧化物可破坏核酸的磷酸二酯键。 (2)安全操作 酚腐蚀性很强,并可引起严重的灼伤,操作时应戴手套。2.3核酸的沉淀2.3.1核酸沉淀的盐类及浓度2.3.2有机沉淀剂(2)异丙醇(3)聚乙二醇(PEG)(4)精胺2.3.3核酸沉淀的温度和时间2.4核酸的浓度测定紫外分光光度计测定核酸浓度的操作步骤A:测DNA: 纯的DNA样品OD260/OD280应为1.8,OD260m/OD230应大于2.0。 1)OD260/OD280大于1.9时,表明有RNA污染。 2)小于1.6时,表明样品中存在蛋白质或酚污染; 3)OD260/OD230小于2.0时,表明溶液中有残存的盐和小分子杂质,如核苷酸、氨基酸、酚等。 注:可能出现既含蛋白质又含RNA的DNA溶液比值为1.8的情况。B:测RNA 纯的RNA样品其OD260/OD280应介于1.7-2.0之间,OD260/OD230比值应大于2.0。 1)若RNA样品OD260/OD280比值太小,说明有蛋白质或酚的污染; 2)比值大于2.0时,可能被异硫氰酸胍等污染; 3)OD260/OD230比值小于2.0时表明有小分子及盐存在。2.4.2溴乙锭荧光法测定核酸的含量2.5核酸的保存