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第十二章 RNA生物合成 (RNABiosynthesis) 本章要求: RNA聚合酶及转录的一般特点 真核生物的转录过程 转录的转录过程:起始:(启动子),延长,终止 真核生物转录后的加工:剪切,填加及修饰 原核生物的转录过程 RNA的复制 第一节RNA聚合酶及RNA转录的一般特点图12-1RNA链中3’,5’-磷酸二酯键的形成 RNA的合成的方向为5’→3’;聚合反应是通过核苷酸之间形成的3’,5’-磷酸二酯键,使核苷酸链延长,同时释放出焦磷酸。表12-1真核生物RNA聚合酶的种类和性质二、RNA转录与DNA复制异同点RNA转录与DNA复制不同点: 1.RNA转录是不对称的,即仅用DNA双链中某一单链作为模板进行转录,被作为模板的那条DNA单链称模板链(templatestrand)。与模板链互补的DNA单链为编码链(codingstrand),即合成的RNA碱基序列与编码链相同,仅是U替代了T。在特定的染色体中,有时基因的编码序列可能位于另一条链中,这种现象称不对称转录。转录后DNA模板成分无改变。图12-2RNA的不对称转录RNA转录与DNA复制不同点: 2.与DNA聚合酶不同,RNA聚合酶不需要引 物,可利用NTP作底物直接合成RNA。 3.RNA聚合酶没有核酸酶的活性,即没有3’到5’ 外切酶的活性,也没有5’到3’外切酶的活性, 因此,在RNA合成过程不起较对作用。 4.对于一个基因组来讲,转录只发生在一部分基 因,而且每一个基因的转录都受到相对独立的 控制。 5.RNA合成后需要加工才能成为有功能的 RNA。真核生物转录过程除了RNA聚合酶参加外,还需要一些蛋白质因子参与,这些因子能结合到DNA的特殊序列并且与RNA聚合酶结合,促进转录。一类通用转录因子(generaltranscriptionfactors,TF)分别能够与不同的RNA聚合酶结合,形成转录复合体。通用转录因子分类mRNA的合成是在核内由RNA聚合酶Ⅱ催化的。酵母RNA聚合酶Ⅱ由12个亚基组成。其中最大亚基的羧基末端结构域(carboxyl-terminaldomain,CTD),富含丝氨酸残基。CTD的磷酸化和去磷酸化对酶的活性有重要影响。去磷酸化的CTD在转录的起始中作用,在转录延长过程中CTD的丝氨酸残基被磷酸化。mRNA的合成还需要有一系列转录因子Ⅱ(TFⅡ)参加。2.转录因子II及转录前起始复合物的形成 mRNA的合成是在核内由RNA聚合酶II催化的,有一系列转录因子II(TFII)参加。图12-4mRNA转录前起始复合物 RNA聚合酶Ⅱ与其转录因子组成转录前起始复合物。按其组成的结合顺序排列为:TFⅡDABF-PolEH(Pol代表RNA聚合酶Ⅱ)。覆盖DNA模板大约70bp.第一个磷酸二酯键的形成: 此附近DNA双链被RNA聚合酶解开约17个碱基对,形成一个转录泡(由闭合复合物转变成开放复合物)。根据DNA模板链上核苷酸的序列,以NTP为原料,按碱基互补原则在RNA聚合酶催化下,形成第一个3’,5’-磷酸二酯键。头一个核苷酸多为嘌呤核苷酸A或G。(二)RNA链的延长 RNA聚合酶沿着DNA模板从5’→3’方向移动并不断的解开DNA双链,同时与DNA模板链序列相互补的核苷酸逐一地进入反应体系,RNA聚合酶II的CTD被转录延长因子(TEFb)进一步磷酸化,增强了聚合酶的活性。如此,合成的RNA逐渐延长(elongation)(图12-5)。 RNA链延长时,新合成的部分暂时与模板DNA形成一段RNA-DNA杂合双螺旋;随着RNA链的延伸,RNA从RNA-DNA双螺旋解开。DNA双螺旋的解旋及重新恢复双螺旋是在DNA拓扑异构酶的作用下进行的。TFIIE和TFIIH对于RNA链的延长不是必需的,它们从延长的复合物上解离下来,TBP和TFIIB保留在启动子上。图12-5RNA链的延长RNA链的延长过程 A.RNA聚合酶II在转录因子的辅助下,将双链DNA解开一段,形成转录泡。在聚合酶的作用下以NTP为底物,与模板链的碱基互补开始合成RNA。 B.复制泡扩大,RNA聚合酶II继续合成RNA,以U替代 T,A-U、C-G配对。 C.随着RNA链的延长,RNA聚合酶沿着模板链不断滑动,在DNA拓朴异构酶的作用下,下游不断解链,上游不断恢复双链,转录泡不断向下游移动,保持约17bp大小,直到遇到终止信号合成则停止。DNA双螺旋重新形成。(三)转录的终止 RNA聚合酶Ⅱ参与整个转录过程,直到出现多聚腺苷酸化信号为止。这个信号顺序是保守序列AAUAAA和其下游富含GU的序列。这些序列称为转录终止的剪切信号序列(cleavagesignalsequence)。具体的剪切点位于AAUAAA下游10~30核苷酸处,距GU序列20~4