太湖沉积物中的可培养细菌I细菌多样性初步分析.pdf

LakeSci．(湖泊科学)，2009，2l(1)：27-35
http：／／www．jlakes．org．E—mail：[e-mail]
~2009byJournalofLakeSciences

太湖沉积物中的可培养细菌：I．细菌多样性初步分析

周丽华，陈士超3邓志瑞，陈沁，郑乐平，刘志学”

(1：上海大学环境与化学_丁程学院，上海200444)
(2：上海大学生命科学学院，上海200444)
(3：同济大学生命科学与技术学院，上海200092)

摘要：采用牛肉膏培养基培养，从不同深度的太湖沉积物中共分离得到603个菌落形态不同的菌株，通过数值分析比较了40个形
态表征性状，以不加权平均连锁聚类(UPGMA)的方式进行簇群归类，在O．75水平上可分成4个聚类群和51个亚群．从51个亚群中
各随机选取一个菌株，测定其16SrDNA部分序列(约540bp)并据此进行分析，表明这些菌株分别属于Firmicutes、
Actinobacteria、y-Proteobacteria这三大类群，与数据库中已知的芽孢杆菌属(Bacillus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、微球菌
属(Micrococcus)、节杆菌属(rthrobacter)、迪茨菌属(Dietzia)和假单胞菌属(Pseudomonus)细菌具有很高的相似性．其中迪茨菌
属在国内淡水湖泊沉积物中为首次报道．
关键词：太湖；沉积物；可培养细菌；数值分类；多样性

CulturablebacteriainthesedimentofLakeTaihu(I)：primaryanalysisofbacteria
diversity

ZHOULihua，CHENShichao，DENGZhirui，CHENQin，ZHENGLeping＆LIUZhixue
(1：SchoolofEnvironmentalandChemicalEngineering，ShanghaiUniversity，Shanghai200444，PR．China)

(2：SchoolofLScience，ShanghaiUniversity，Shanghai200444，P．RChina)
(3：SchoolofLireScienceandTechnology，Tong／iUniversity，Shanghai200092，PRChina)

Abstract：ThesedimentsamplescollectedfromthedifierentsitesoftheLakeTaihu，2006wereculturedontraditionalnutrient

medium．603bacteriastrainswereseparatedwith40differentmorphologicalfeatures，andweregroupedinto4clustersand51

subclustersatthelevelof0．75withnumericalclassifiedbasedontheunweightedpairgroupmethodwitharithmeticaverages

(UPGMA)algorithm．Basedonthepartialsequencesof16SrDNA(540bp)analysis，thebacteriastrainssamplechosenfromeach

subclustersrandomlywererankedintoFirmicutes，Actinobacteriaand7-Proteobacteriathreegroups，andcloselyrelatedto

Bacillus，Paenibacillus，Micrococcus，Arthrobacter，DietziaandPseudomonasgenera．Thedietziagenerawasreportedinthe

sedimentoffreshwaterlakeinChinaforthefirsttime．

Keyword：LakeTaihu；sediment；culturablebacteria；numericaltaxonomy；diversity

湖泊沉积物的环境效应是水环境研究的重点之一，所关注的主要问题包括沉积物“源”、“汇”转换
的时空变化【”，对污染物的吸附和沉积，以及水一土界面的营养盐、污染物释放通量等【2-3】．除温度、pH值、
溶解氧(DO)、氧化还原电位(ORP)、水动力等物化因素之外llI4J，沉积物和上覆水体组成的二相结构界面
问，存在一个复杂的生物相[6】．微生物由于本身的特点，在其中占有不可或缺的地位，